導(dǎo)讀 我們的目標(biāo)是重建所有鳥類的整個(gè)進(jìn)化史，加州大學(xué)圣地亞哥分校的研究員 Siavash Mirarab 教授說。這項(xiàng)工作是鳥類 10,000 個(gè)基因組 (B...
我們的目標(biāo)是重建所有鳥類的整個(gè)進(jìn)化史，”加州大學(xué)圣地亞哥分校的研究員 Siavash Mirarab 教授說。
這項(xiàng)工作是鳥類 10,000 個(gè)基因組 (B10K) 項(xiàng)目的一部分，該項(xiàng)目是由哥本哈根大學(xué)、浙江大學(xué)和加州大學(xué)圣地亞哥分校牽頭的多機(jī)構(gòu)努力，旨在生成約 10,500 種現(xiàn)存鳥類的基因組序列草案。
這些研究的核心是一套名為 ASTRAL 的算法，Mirarab 教授和同事開發(fā)了該算法，以前所未有的可擴(kuò)展性、準(zhǔn)確性和速度來推斷進(jìn)化關(guān)系。
通過利用這些算法的力量，他們整合了來自 60,000 多個(gè)基因組區(qū)域的基因組數(shù)據(jù)，為他們的分析提供了堅(jiān)實(shí)的統(tǒng)計(jì)基礎(chǔ)。
研究人員隨后檢查了基因組中各個(gè)片段的進(jìn)化歷史。
從那里，他們拼湊出了基因樹的馬賽克，然后將其編譯成綜合的物種樹。
這種細(xì)致的方法使研究人員能夠構(gòu)建一個(gè)新的和改進(jìn)的鳥類家譜，即使在歷史不確定的情況下，也能以驚人的精度和細(xì)節(jié)描繪復(fù)雜的分支事件。
米拉拉布教授說：“我們發(fā)現(xiàn)，在分析中添加數(shù)萬個(gè)基因的方法實(shí)際上對(duì)于解決鳥類物種之間的進(jìn)化關(guān)系是必要的。”
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