當博多·貝克博士第一次看到逃離敘利亞的三個孩子坐在科隆大學醫(yī)院的診室里時，這位人類遺傳學家感到很驚訝。他的基因分析診斷出巴特綜合征 3 型，但他以前從未見過患有這種罕見疾病的患者出現如此嚴重的關節(jié)變化。
腎臟疾病是遺傳性的，受影響的個體缺乏 CLCNKB 基因，該基因負責特定的氯離子通道。由于腎臟在過濾和尿液產生過程中無法將重要的營養(yǎng)物質和鹽重新吸收回血液中，因此電解質平衡被破壞。
除了缺少 CLCNKB 基因之外，貝克懷疑可能存在更廣泛的缺失(從基因組中完全消除的區(qū)域)，這可以解釋嚴重的臨床情況。
為了找到答案，需要更仔細地研究致病基因，因此他聯系了馬克斯德爾布呂克中心和柏林夏里特健康研究所 (BIH) 基因組平臺負責人 Janine Altmüller 博士。
她的團隊位于柏林馬克斯德爾布呂克中心醫(yī)療系統(tǒng)生物學研究所 (MDC-BIMSB)，率先推出了長讀長測序等尖端測序技術。這項技術使他們能夠分析以前無法解析的部分患者基因組。他們現已在《基因組醫(yī)學》雜志上發(fā)表了他們的發(fā)現。
分析復雜結構的工具
傳統(tǒng)的短讀長測序方法涉及將 DNA 分解成許多小片段，然后必須重新組裝。但當涉及復雜的基因組結構時，這些常見的臨床技術就達到了極限，例如當一段 DNA 中的序列重復多次時，就像 3 型 Bartter 綜合征的情況一樣。這就解釋了為什么之前沒有人檢查過這種技術。受影響基因的精細結構。
另一方面，長讀長測序可以在一次運行中準確讀取更長的 DNA 片段，通常是數千甚至數萬個堿基對。因此，這個由復雜的重復圖案組成的巨大拼圖的各個部分都更大，從而更容易將它們正確地重新組合在一起。正是這一進步使得《自然方法》雜志將長讀長測序評為 2022 年年度方法。
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