科學(xué)家首次發(fā)布人類Y染色體完整序列 研究人員組裝了人類Y染色體的第一個(gè)完整序列 厄爾尼諾和拉尼娜多年事件可能變得更加常見(jiàn) 珊瑚的素食解釋了可追溯到達(dá)爾文的古老謎團(tuán) 一淘APP怎么查看集分寶規(guī)則(一淘怎么得集分寶) 如何查詢自己的普通話證書(如何查詢自己的普通話證書等級(jí)) 野生動(dòng)物泛濫豐富了公園邊界之外的生物多樣性 word如何刪除頁(yè)腳頁(yè)眉?頁(yè)眉頁(yè)腳怎么設(shè)置 ?(word里面怎么刪除頁(yè)眉和頁(yè)腳) DNF婚禮進(jìn)行時(shí)(dnf婚禮怎么直接開始) 怎么制作水果花束(怎么制作水果花束簡(jiǎn)單) 【校園指南】東華理工大學(xué)上網(wǎng)篇(東華理工大學(xué)網(wǎng)絡(luò)與信息中心網(wǎng)站) 音頻格式怎么轉(zhuǎn)換成mp3格式(電腦音頻格式怎么轉(zhuǎn)換成mp3格式) 跑跑卡丁車手游怎么更換頭像框(跑跑卡丁車手游怎么更換頭像框框) 魔獸世界碧火薩特任務(wù)怎么做 碧火魔仆怎么殺? 公秋母秋怎么區(qū)分(公秋母秋區(qū)別) 腿短的人穿什么褲子(腿短的人穿什么褲子顯腿長(zhǎng)) 我的世界怎么生孩子(我的世界怎么生孩子 需要什么條件) 最新卷發(fā)發(fā)型扎法 靈動(dòng)浪漫招蜜運(yùn)(卷發(fā)扎發(fā)型的多種扎法圖解) PS怎么做圖片曝光(ps怎么做曝光效果) 瑜伽動(dòng)作名稱及圖解(瑜伽動(dòng)作名稱及圖解大全) 電腦怎么清理磁盤空間(微信電腦怎么清理磁盤空間) 如何去了解未知領(lǐng)域(如何去了解未知領(lǐng)域信息) 網(wǎng)購(gòu)浴室柜經(jīng)驗(yàn)分享(網(wǎng)購(gòu)浴室柜經(jīng)驗(yàn)分享怎么寫) 【小游戲系列】- 越獄父子3攻略(4399小游戲之越獄父子) 英雄聯(lián)盟紅包封面2022領(lǐng)取攻略(英雄聯(lián)盟紅包封面2022領(lǐng)取攻略圖片) 魔獸世界狂暴戰(zhàn)單刷旋云之巔北風(fēng)幼龍坐騎心得 怎么做好吃的杏鮑菇?(怎么做好吃的杏鮑菇炒肉) 如何在網(wǎng)上訂餐肯德基(如何在網(wǎng)上訂餐肯德基漢堡) 如何正確防治青少年近視(如何正確防治青少年近視問(wèn)題作文) 三國(guó)塔防魏傳攻略(三國(guó)塔防魏傳攻略大全) 重慶有啥好玩的地方景點(diǎn)(重慶有啥好玩的地方景點(diǎn)推薦一下) 北京、杭州勞務(wù)市場(chǎng)在哪里(杭州勞務(wù)市場(chǎng)在哪兒) 魔獸世界流沙之鱗聲望怎么開啟?(魔獸世界流沙之鱗聲望怎么刷) 服務(wù)器系統(tǒng)怎么安裝(電腦服務(wù)器系統(tǒng)怎么安裝) 怎么檢查網(wǎng)站死鏈(網(wǎng)站死鏈接檢測(cè)) 美甲常用的工具有哪些?(美甲常用的工具有哪些圖片) 《小幸運(yùn)》吉他譜-完整版(小幸運(yùn) 原版吉他譜高清) 怎么樣快速借貸(怎么樣快速借貸到銀行卡) 嬰兒著涼腹瀉怎么辦(嬰兒著涼腹瀉怎么辦緩解) 玻璃怎么樣擦的又干凈又快(玻璃怎么樣擦的又干凈又快?小妙招) 摩爾莊園怎么捕捉沃特爾(摩爾莊園沃特爾怎么抓) 劍俠世界2職業(yè)裝備怎么穿戴(劍俠世界2職業(yè)裝備怎么穿戴視頻) 比心app是什么?比心app怎么使用?(比心這個(gè)app怎么樣) wps:如何禁止自動(dòng)升級(jí)(wps怎么禁止升級(jí)) 散養(yǎng)鴿子窩怎樣搭建(散養(yǎng)鴿子窩怎樣搭建視頻) 蘋果手機(jī)5S怎么樣?(蘋果手機(jī)5s怎么樣下沒(méi)允許的東西) 手機(jī)自動(dòng)連點(diǎn)器教程(自動(dòng)連點(diǎn)器怎么用手機(jī)版) 360安全衛(wèi)士怎么進(jìn)行強(qiáng)力查殺(360安全衛(wèi)士強(qiáng)力查殺后電腦壞了) 怎樣增大手機(jī)音量?(怎樣增大手機(jī)音量) 蘋果手機(jī)如何恢復(fù)出廠設(shè)置(蘋果手機(jī)如何恢復(fù)出廠設(shè)置忘記密碼)
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科學(xué)家首次發(fā)布人類Y染色體完整序列

導(dǎo)讀 幾十年來(lái),Y 染色體(人類兩條性染色體之一)由于其結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,一直給基因組學(xué)界的測(cè)序帶來(lái)巨大挑戰(zhàn)?,F(xiàn)在,基因組中這一難以捉摸的區(qū)域...

幾十年來(lái),Y 染色體(人類兩條性染色體之一)由于其結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,一直給基因組學(xué)界的測(cè)序帶來(lái)巨大挑戰(zhàn)?,F(xiàn)在,基因組中這一難以捉摸的區(qū)域已被完全測(cè)序,這一壯舉最終完成了一套端到端的人類染色體,并為人類基因組參考添加了 3000 萬(wàn)個(gè)新堿基,其中大部分來(lái)自測(cè)序困難的衛(wèi)星 DNA。這些堿基揭示了 41 個(gè)額外的蛋白質(zhì)編碼基因,并為研究與繁殖、進(jìn)化和種群變化相關(guān)的重要問(wèn)題的人們提供了重要的見(jiàn)解。

由加州大學(xué)圣克魯斯分校生物分子工程助理教授 Karen Miga 共同領(lǐng)導(dǎo)的端粒到端粒 (T2T) 聯(lián)盟的研究人員在《自然》雜志上發(fā)表的一篇新論文中宣布了這一成果。完整的、帶注釋的 Y 染色體參考可在 UCSC 基因組瀏覽器上使用,并可通過(guò) Github 訪問(wèn)。

“就在幾年前,人類 Y 染色體的一半(參考文獻(xiàn)中)缺失了,即具有挑戰(zhàn)性、復(fù)雜的衛(wèi)星區(qū)域,”該論文的共同主要作者、加州大學(xué)圣克魯斯分校生物分子工程博士后學(xué)者莫妮卡·切喬娃 (Monika Cechova) 說(shuō)。“當(dāng)時(shí)我們甚至不知道它是否可以測(cè)序,這太令人困惑了。這確實(shí)是一個(gè)巨大的轉(zhuǎn)變。”

完成Y

當(dāng)科學(xué)家和臨床醫(yī)生研究個(gè)體的基因組時(shí),他們會(huì)將個(gè)體的 DNA 與標(biāo)準(zhǔn)參考的 DNA 進(jìn)行比較,以確定哪里存在變異。到目前為止,人類基因組的 Y 染色體部分存在很大的缺口,這使得理解變異和相關(guān)疾病變得困難。

Y染色體的結(jié)構(gòu)一直難以解碼,因?yàn)橐恍〥NA是以回文形式組織的——前后相同的長(zhǎng)序列——跨越超過(guò)一百萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)。此外,之前版本的 Y 參考中缺失的 Y 染色體的很大一部分是衛(wèi)星 DNA,即大型、高度重復(fù)的非蛋白質(zhì)編碼 DNA 區(qū)域。在 Y 染色體上,兩個(gè)衛(wèi)星相互連接,使測(cè)序過(guò)程進(jìn)一步復(fù)雜化。

由于長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)和新的創(chuàng)新計(jì)算組裝方法的進(jìn)步,研究人員能夠?qū)崿F(xiàn) Y 染色體的無(wú)縫讀取,這些方法可以處理重復(fù)序列并將測(cè)序的原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為可用資源。這些新方法組合使團(tuán)隊(duì)能夠解決 Y 染色體的一些特別具有挑戰(zhàn)性的方面,例如精確定位回文序列中發(fā)生倒位的位置——一種可用于查找其他倒位的技術(shù)。論文中建立的方法將使科學(xué)家能夠完成更多人類 Y 染色體的端到端讀取,以更好地了解這種遺傳物質(zhì)如何影響不同的人類群體。

“Y 染色體缺乏先前參考基因組中最多的序列,”國(guó)家人類基因組研究所的科學(xué)家、該論文的主要作者 Arang Rhie 說(shuō)。“每當(dāng)我們嘗試進(jìn)行任何基于參考的分析時(shí),知道我們錯(cuò)過(guò)了 Y 的一半總是令人惱火。我真的很高興能夠策劃第一個(gè)完整的 Y,看看我們實(shí)際上缺少什么,以及我們現(xiàn)在可以做什么。”

2018年,Miga和她的同事發(fā)布了第一個(gè)人類Y染色體著絲粒的完整圖譜。第一個(gè)間隙閉合被認(rèn)為是獲得超長(zhǎng)數(shù)據(jù)的功勞,該數(shù)據(jù)建立在納米孔測(cè)序技術(shù)的基礎(chǔ)上,該技術(shù)起源于加州大學(xué)圣迭戈分校。當(dāng)時(shí)很明顯,新興技術(shù)和高覆蓋率長(zhǎng)讀長(zhǎng)數(shù)據(jù)集有潛力端到端地完成整個(gè)染色體,這導(dǎo)致了由 Phillippy 和 Miga 共同領(lǐng)導(dǎo)的 T2T 聯(lián)盟的成立。

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