近年來(lái),計(jì)算病理學(xué)領(lǐng)域取得了快速進(jìn)展,這是指計(jì)算方法在病理工作流程中的應(yīng)用。傳統(tǒng)病理學(xué)涉及通過(guò)檢查組織、器官和體液來(lái)研究疾病。在計(jì)算病理學(xué)中,使用計(jì)算機(jī)算法分析數(shù)字病理圖像以提取有意義的信息。
為此,機(jī)器學(xué)習(xí)、圖像分析和數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)被用來(lái)協(xié)助病理學(xué)家完成疾病診斷和預(yù)后等任務(wù)。數(shù)字病理學(xué)的采用工作流程、這些圖像的大數(shù)據(jù)集的發(fā)布以及計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施的改進(jìn)都促進(jìn)了最近的技術(shù)進(jìn)步。
計(jì)算病理學(xué)中的方法可以大致分為兩個(gè)目標(biāo)。首先,常規(guī)工作流程的自動(dòng)化,否則將由病理學(xué)家執(zhí)行,其次是增加新功能。
菲利普·韋茨博士在他的論文中醫(yī)學(xué)流行病學(xué)和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)系的學(xué)生,專注于新能力,即新方法的開(kāi)發(fā)、應(yīng)用和評(píng)估,特別是從病理圖像預(yù)測(cè)基因表達(dá)以及病理圖像之間的配準(zhǔn)。這有可能提高精確診斷的質(zhì)量和獲取精確診斷的機(jī)會(huì)。
您的論文中最重要的結(jié)果是什么?
我的論文包括五項(xiàng)研究。其中兩項(xiàng)重點(diǎn)關(guān)注從組織病理學(xué)圖像預(yù)測(cè)基因表達(dá)的方法的開(kāi)發(fā)和評(píng)估。在這些研究中,我們發(fā)現(xiàn)共表達(dá)簇中基因表達(dá)的預(yù)測(cè)顯著降低了計(jì)算成本,同時(shí)可能提高預(yù)測(cè)性能。此外,我們發(fā)現(xiàn)基于注意力的多實(shí)例學(xué)習(xí)似乎并沒(méi)有提高基因表達(dá)預(yù)測(cè)性能,同時(shí)可能更容易受到過(guò)度擬合的影響。
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