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全面的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集可幫助癌癥研究人員解開分子之謎

導讀 美國國立衛(wèi)生研究院正在發(fā)布一個全面的數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集對來自 10 種癌癥類型的 1,000 多個腫瘤的單獨研究的基因組、蛋白質(zhì)組、成像和...

美國國立衛(wèi)生研究院正在發(fā)布一個全面的數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集對來自 10 種癌癥類型的 1,000 多個腫瘤的單獨研究的基因組、蛋白質(zhì)組、成像和臨床數(shù)據(jù)進行了標準化。來自世界各地的研究人員將能夠利用這一公開資源來揭示有關(guān)癌癥如何發(fā)展和進展的新分子見解。該數(shù)據(jù)集由美國國立衛(wèi)生研究院下屬國家癌癥研究所的臨床蛋白質(zhì)組學腫瘤分析聯(lián)盟 (CPTAC) 生成。

《Cancer Cell》發(fā)表的一篇論文描述了泛癌蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)集,它建立在蛋白質(zhì)組科學數(shù)十年的技術(shù)進步的基礎(chǔ)上。該數(shù)據(jù)集的推出支持-哈里斯政府的“癌癥登月”目標,即通過改進數(shù)據(jù)共享加速癌癥研究。

CPTAC 研究人員在《 Cell》上發(fā)表的另外兩篇研究論文初步證明了該數(shù)據(jù)集作為科學發(fā)現(xiàn)的寶貴資源的潛力。在第一篇論文中,多組學分析用于將癌癥驅(qū)動突變與蛋白質(zhì)模式聯(lián)系起來。第二篇論文深入研究了調(diào)節(jié)細胞信號傳導和生理學的蛋白質(zhì)修飾,以顯示不同腫瘤類型與 DNA 修復、代謝和免疫的關(guān)聯(lián)。

泛癌癥蛋白質(zhì)基因組數(shù)據(jù)集將通過 NCI 癌癥研究數(shù)據(jù)共享存儲庫公開提供。蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)可以通過蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)共享訪問。基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以通過基因組數(shù)據(jù)共享和癌癥數(shù)據(jù)服務(wù)訪問。

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