IntelliGenes 是羅格斯健康學(xué)院創(chuàng)建的首個(gè)同類(lèi)軟件,據(jù)其開(kāi)發(fā)人員稱(chēng),它結(jié)合了人工智能 (AI) 和機(jī)器學(xué)習(xí)方法來(lái)測(cè)量特定基因組生物標(biāo)志物的重要性,以幫助預(yù)測(cè)個(gè)體疾病。
發(fā)表在《生物信息學(xué)》上的一項(xiàng)研究解釋了廣大用戶如何利用 IntelliGenes 來(lái)分析多基因組和臨床數(shù)據(jù)。
該研究的主要作者、羅格斯大學(xué)健康、醫(yī)療保健政策和老齡化研究所 (IFH) 的教員 Zeeshan Ahmed 表示,目前還沒(méi)有人工智能或機(jī)器學(xué)習(xí)工具可用于研究和解釋完整的人類(lèi)基因組,特別是對(duì)于非專(zhuān)家。艾哈邁德和他的羅格斯實(shí)驗(yàn)室成員設(shè)計(jì)了 IntelliGenes,以便任何人都可以使用該平臺(tái),包括學(xué)生或那些不具備豐富的生物信息學(xué)技術(shù)知識(shí)或無(wú)法使用高性能計(jì)算機(jī)的人。
該軟件將傳統(tǒng)的統(tǒng)計(jì)方法與尖端的機(jī)器學(xué)習(xí)算法相結(jié)合,產(chǎn)生個(gè)性化的患者預(yù)測(cè)和對(duì)疾病預(yù)測(cè)具有重要意義的生物標(biāo)志物的可視化表示。
在《科學(xué)報(bào)告》上發(fā)表的另一項(xiàng)研究中,研究人員應(yīng)用 IntelliGenes 發(fā)現(xiàn)新型生物標(biāo)志物并高精度預(yù)測(cè)心血管疾病。
“數(shù)據(jù)集的融合以及人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)的驚人發(fā)展具有巨大的潛力,”羅伯特伍德約翰遜醫(yī)學(xué)院的醫(yī)學(xué)助理教授艾哈邁德說(shuō)。
“IntelliGenes 可以支持對(duì)個(gè)體常見(jiàn)和罕見(jiàn)疾病進(jìn)行個(gè)性化早期檢測(cè),并為更廣泛的研究開(kāi)辟途徑,最終帶來(lái)新的干預(yù)措施和治療方法。”
研究人員使用 Amarel 測(cè)試了該軟件,Amarel 是由羅格斯大學(xué)高級(jí)研究計(jì)算辦公室管理的高性能計(jì)算集群。該辦公室為從事復(fù)雜計(jì)算和數(shù)據(jù)密集型項(xiàng)目的羅格斯大學(xué)研究人員提供研究計(jì)算和數(shù)據(jù)環(huán)境。
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