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如何繪制與疾病嚴(yán)重程度相關(guān)的病毒蛋白圖譜?

導(dǎo)讀 一群艾滋病研究人員、細(xì)胞生物學(xué)家和生物物理學(xué)家共同支持新冠科學(xué)。他們確定了蛋白的原子結(jié)構(gòu),認(rèn)為該蛋白有助于病原體逃逸,抑制人體免疫

一群艾滋病研究人員、細(xì)胞生物學(xué)家和生物物理學(xué)家共同支持新冠科學(xué)。他們確定了蛋白的原子結(jié)構(gòu),認(rèn)為該蛋白有助于病原體逃逸,抑制人體免疫細(xì)胞的反應(yīng)。該結(jié)構(gòu)圖現(xiàn)已發(fā)表在《PNAS》雜志上,但自8月份以來一直對科學(xué)界開放,它為專門為新型量身定制的新型抗病毒治療奠定了基礎(chǔ),并使進(jìn)一步研究新出現(xiàn)的病毒對人體的損害成為可能。

“利用X射線晶體學(xué),我們建立了ORF8的原子模型,并突出了兩個獨特的區(qū)域:一個只存在于新型及其直系蝙蝠祖先,另一個沒有任何其他。”加州大學(xué)伯克利分校教授、前勞倫斯伯克利國家實驗室(伯克利實驗室)科學(xué)家詹姆斯赫爾利說。“這些區(qū)域已經(jīng)穩(wěn)定了這種蛋白,這種蛋白是一種分泌蛋白,不像病毒的特征蛋白那樣與膜結(jié)合,產(chǎn)生新的分子間界面。我們研究界的其他人認(rèn)為這些界面參與了某種程度的反應(yīng)。新型的致病性高于其進(jìn)化高度?!?

聚焦結(jié)構(gòu)生物學(xué)

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)圖的生成總是費力的,因為科學(xué)家必須設(shè)計細(xì)菌,它可以提取大量的分子,將分子操縱成純晶體形式,然后對晶體進(jìn)行多次X射線衍射成像。這些圖像——由晶體中原子的X射線束反射并穿過晶格中的間隙,產(chǎn)生斑點圖案——通過特殊的軟件進(jìn)行組合和分析,以確定每個原子的位置。根據(jù)蛋白質(zhì)的復(fù)雜性,這個艱巨的過程可能需要幾年時間。

對于許多蛋白質(zhì)來說,通過將未溶解分子的結(jié)構(gòu)與具有相似氨基酸序列的其他蛋白質(zhì)進(jìn)行比較,有助于構(gòu)建圖譜。科學(xué)家可以對蛋白質(zhì)如何折疊成三維形狀做出明智的猜測。

但是對于ORF8來說,團(tuán)隊必須從零開始。ORF8的氨基酸序列與其他蛋白質(zhì)完全不同,所以科學(xué)家對它的整體形狀沒有參考,而蛋白質(zhì)的3D形狀決定了它的功能。

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