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檢測病毒 RNA 的創(chuàng)新方法

導讀 來自巴塞羅那大學、加泰羅尼亞高等化學研究所(IQAC-CSIC)、巴塞羅那微電子研究所(IMB-CNM-CSIC)和阿拉貢納米科學與材料研究所(INMA)的專家C

來自巴塞羅那大學、加泰羅尼亞高等化學研究所(IQAC-CSIC)、巴塞羅那微電子研究所(IMB-CNM-CSIC)和阿拉貢納米科學與材料研究所(INMA)的專家CSIC 和薩拉戈薩大學——開發(fā)了一種基于三鏈體形成探針技術的 RNA 病毒檢測新方法。這種創(chuàng)新方法為檢測 SARS-CoV-2、甲型流感病毒 (H1N1) 或呼吸道合胞病毒 (RSV) 等病毒開辟了新的選擇,RSV 是一種影響新生兒的病原體,需要仔細鑒別診斷。

這項跨學科研究發(fā)表在國際分子科學雜志上,由巴塞羅那大學藥學與食品科學學院和納米科學與納米技術研究所 (IN2UB) 的 Carlos J. Ciudad 和 Verónica Noe 領導;Ramón Eritja、Anna Aviñó、Lluïsa Vilaplana 和 M. Pilar Marco,來自 IQAC-CSIC 和 CIBER 的生物工程、生物材料和納米醫(yī)學 (CIBER-BBN);來自 IMB-CNM-CSIC 的 Manuel Gutiérrez、Antoni Baldi 和 César Fernández,以及納米科學與材料研究所和 Aragón INMA (CSIC-UNIZAR) 和 CIBER-BBN 的 CSIC 研究人員 Valeria Grazu 和 Jesús Martínez。

該研究是在 PoC4CoV 項目的背景下進行的,該項目由 M. Pilar Marco 和 César Fernández 領導,并由 CSIC 的全球健康平臺 (PTI) 資助。作為由 La Marató de TV3 2020 資助的一個項目的一部分,這項研究繼續(xù)進行,以對抗 COVID-19,UB 化學學院的專家也參與了該項目。

聚嘌呤發(fā)夾捕獲病毒 RNA

新方法基于 UB 癌癥治療小組設計的聚嘌呤發(fā)夾 (PPRH) 捕獲病毒 RNA 并形成高親和力三鏈體的能力。當這種混合結(jié)構連接到分子探針并與受影響患者的樣本接觸時,就會獲得病毒因子的檢測信號??茖W出版物中介紹的方法稱為三重增強核酸檢測分析 (TENADA)。

“PPRHs 是未修飾的單鏈 DNA 發(fā)夾,由兩個反平行多嘌呤的鏡面結(jié)構域組成。這些結(jié)構域通過胸苷環(huán)相互連接,通過分子內(nèi)反向 Hoogsteen 鍵連接。分子發(fā)夾可以特異性結(jié)合單鏈聚嘧啶序列-鏈 DNA (ssDNA)、雙鏈 DNA (dsDNA) 或 RNA 病毒通過 Watson-Crick 鍵,從而形成反平行三鏈體”,UB 生物化學與生理學系的 Carlos J. Ciudad 教授說。

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