精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)力求使治療適應(yīng)每位患者的特點(diǎn)?;蚪M研究正在提供越來越多的數(shù)據(jù)來實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo),但這種非常豐富的信息阻礙了這項任務(wù):醫(yī)生必須解釋大量的基因改變,而只有少數(shù)與診斷每種癌癥的類型和階段有關(guān),并決定如何對待它。
為了促進(jìn)這項任務(wù),國家癌癥研究中心 (CNIO) 的生物信息學(xué)部門和維哥大學(xué)剛剛啟動了 PanDrugs2 軟件程序,該程序生成報告以促進(jìn)臨床決策。
PanDrugs2 分析每個患者的基因組數(shù)據(jù)以尋找分子靶點(diǎn),換句話說,現(xiàn)有藥物作用于的分子。該平臺為相關(guān)基因計算一個評分系統(tǒng),為可能對它們起作用的藥物計算另一個評分系統(tǒng)。獲得最高分的藥物具有最充分的科學(xué)證據(jù),可以有效對抗在患者體內(nèi)檢測到的治療靶點(diǎn)。根據(jù)這些分?jǐn)?shù),該工具生成治療排名
該平臺總共處理 4,642 個基因和 14,659 種獨(dú)特化合物的數(shù)據(jù)?;谶@些信息,它在藥物和基因之間產(chǎn)生了 74,000 個關(guān)聯(lián)。
PanDrugs2 的開發(fā)由 CNIO 生物信息學(xué)部門負(fù)責(zé)人 Fátima Al-Shahrour 和 CINBIO 新一代信息系統(tǒng)小組研究員維哥大學(xué)的 Daniel Gonzalez Peña 共同指導(dǎo)。PanDrugs2 剛剛被刊登在《核酸研究》雜志上。
“PanDrugs2 旨在幫助鞏固臨床實(shí)踐中的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué),”CNIO 生物信息學(xué)部門的研究員、該論文的合著者 Gonzalo Gómez-López 說。“我們一直在尋找一種清晰的顯示格式,讓專業(yè)人士非常容易理解,但仍然詳盡無遺。我們希望迄今為止所有可用的知識都可用于醫(yī)療咨詢。”
批準(zhǔn)的、試驗(yàn)的和試用的藥物
PanDrugs2 改進(jìn)了五年前發(fā)布的舊版 PanDrugs 平臺。例如,它是第一個考慮遺傳(或生發(fā))突變以及受孕(或體細(xì)胞)后產(chǎn)生的突變的平臺。這是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的重要信息,因?yàn)檫z傳突變“導(dǎo)致個體之間在所需藥物劑量方面的差異。或者導(dǎo)致一種物質(zhì)比另一種物質(zhì)更有效,”Gonzalo Gómez-López 解釋說。
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