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超級(jí)計(jì)算機(jī)加入了對(duì)抗抗生素耐藥性的斗爭(zhēng)

導(dǎo)讀 參與的研究人員在波鴻魯爾大學(xué)(RUB)、德國(guó)杜伊斯堡-埃森大學(xué)(UDE)、英國(guó)樸茨茅斯大學(xué)以及澳大利亞昆士蘭大學(xué)和以色列魏茨曼研究所工作。新

參與的研究人員在波鴻魯爾大學(xué)(RUB)、德國(guó)杜伊斯堡-埃森大學(xué)(UDE)、英國(guó)樸茨茅斯大學(xué)以及澳大利亞昆士蘭大學(xué)和以色列魏茨曼研究所工作。

新抗生素研發(fā)困難重重

開發(fā)一種新的抗生素特別困難,而且自 1960 年代以來,幾乎沒有開發(fā)出新的抗生素類別。在目前的研究中,研究人員采用了另一種方法。他們沒有開發(fā)一種全新的類型,而是從已經(jīng)存在的抗生素開始,然后對(duì)其進(jìn)行修改。為此,他們使用了一種策略,通過計(jì)算模擬候選人的幾個(gè)方面。除其他外,抗生素的溶解度、穿透細(xì)菌膜的效率以及阻斷病原體蛋白質(zhì)產(chǎn)生的效率對(duì)其有效性都很重要。“在實(shí)際合成之前對(duì)化合物是否具有活性進(jìn)行計(jì)算評(píng)估避免了化學(xué)浪費(fèi)。”RUB 的 RESOLV 教授 Frank Schulz 解釋道。

頭對(duì)頭

過去表明,對(duì)新抗生素產(chǎn)生抗藥性的時(shí)間通常不會(huì)太久。因此,預(yù)計(jì)細(xì)菌將針對(duì)研究人員的對(duì)策制定對(duì)策,并對(duì)新的抗生素變體產(chǎn)生抗藥性。“我們希望通過這項(xiàng)研究表明,可以通過計(jì)算策略以系統(tǒng)的方式解決細(xì)菌的耐藥機(jī)制,從而幫助更快、更經(jīng)濟(jì)地開發(fā)新的抗生素衍生物”,該研究所負(fù)責(zé)人 Elsa Sanchez-Garcia 教授解釋說。 UDE 的計(jì)算生物化學(xué)組和 RESOLV 的首席研究員。“通過這種方式,科學(xué)可以不斷地反擊新抗生素的計(jì)算機(jī)輔助開發(fā)。”

有前途的候選人

對(duì)超級(jí)計(jì)算機(jī)計(jì)算的結(jié)果進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)測(cè)試。在研究中,研究團(tuán)隊(duì)不僅實(shí)施了基于計(jì)算機(jī)的模擬方法,還提出了一種新的有前景的候選藥物。與世界衛(wèi)生組織基本藥物清單上的兩種已知抗生素相比,該候選藥物仍必須進(jìn)行臨床測(cè)試,其對(duì)測(cè)試細(xì)菌菌株的活性高達(dá) 56 倍。新的抗生素變體不僅對(duì)測(cè)試的目標(biāo)生物更有效,而且對(duì)世界衛(wèi)生組織優(yōu)先列表中排名最高的三種細(xì)菌也顯示出活性,而現(xiàn)有測(cè)試的抗生素對(duì)其無效。除了這一成功之外,還創(chuàng)建了一個(gè)具有抗菌活性的化合物庫(kù),

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