Kuruma 蝦是亞洲重要的經(jīng)濟(jì)物種，在被視為美味佳肴，已經(jīng)建立了大型對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)。
盡管它很重要，但迄今為止對(duì)該物種的遺傳工作很少，導(dǎo)致對(duì)其基本生物學(xué)的了解有限。
研究人員使用兩種不同的技術(shù)來建立有用的遺傳資源，可用于漁業(yè)管理或建立育種計(jì)劃。
他們希望這種資源可以發(fā)現(xiàn)與免疫、生長(zhǎng)和繁殖相關(guān)的基因。
沖繩科技大學(xué)研究生院 (OIST) 和東京海洋科技大學(xué)的新研究為車馬蝦提供了有用的遺傳資源。這些是最大的對(duì)蝦種類之一(雌蝦的長(zhǎng)度可達(dá) 27 厘米!)，遍布洋和太平洋。在，他們被認(rèn)為是美味，自20年代初一直是主要的漁業(yè)和水產(chǎn)養(yǎng)殖產(chǎn)品(特別是在沖繩)個(gè)世紀(jì)。但是養(yǎng)蝦場(chǎng)的一個(gè)大問題是動(dòng)物的高密度意味著疾病傳播很快。
一種有關(guān)疾病是一種稱為白斑病的病毒感染，它是全世界對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)最具威脅的病原體之一。它具有致命性和高度傳染性;在短短幾天內(nèi)摧毀了整個(gè)農(nóng)場(chǎng)。
“我們對(duì)水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物與疾病相關(guān)細(xì)菌和病毒之間的關(guān)系很感興趣，”OIST海洋基因組組組長(zhǎng) Eiichi Shoguchi 博士解釋說。“手頭擁有這種遺傳資源可能有助于生產(chǎn)抗病蝦或疫苗品系。”
在 OIST 的DNA 測(cè)序部門的支持下，研究人員使用了兩種不同的技術(shù)——基因組測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序——來生產(chǎn)這種遺傳資源。他們的工作發(fā)表在G3: Genes l Genomes l Genetics 上。
基因組是在每個(gè)細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的全套遺傳信息。它被細(xì)分為基因。這些基因由 DNA 堿基對(duì)組成，每個(gè)基因都包含產(chǎn)生蛋白質(zhì)所需的指令，從而導(dǎo)致細(xì)胞得到適當(dāng)?shù)淖o(hù)理和維護(hù)。為了執(zhí)行指令，必須首先將 DNA 轉(zhuǎn)錄成 RNA。轉(zhuǎn)錄組是所有這些基因讀數(shù)的集合。在某些方面，轉(zhuǎn)錄組可以被認(rèn)為是基因組的反映。一些基因可能與抗病性有關(guān)，而一些個(gè)體可能包含這些基因的變異，從而導(dǎo)致更強(qiáng)的抗病性。如果這些基因能夠被鑒定出來，那么就有可能建立一個(gè)抗病蝦品系。
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