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無偏見的組學(xué)方法發(fā)現(xiàn)HIV-1體內(nèi)宿主限制因素

導(dǎo)讀 馬里蘭州沃爾特·里德陸軍研究所領(lǐng)導(dǎo)的研究證實了之前針對HIV-1的宿主限制因素的研究結(jié)果。在《科學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》雜志上發(fā)表的一篇題??為單...

馬里蘭州沃爾特·里德陸軍研究所領(lǐng)導(dǎo)的研究證實了之前針對HIV-1的宿主限制因素的研究結(jié)果。在《科學(xué)轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》雜志上發(fā)表的一篇題??為“單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)識別體內(nèi)HIV-1胸腺肽α限制”的論文中,作者詳細(xì)介紹了組學(xué)如何在尋找治療策略中揭示相關(guān)性。

使用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)來鑒定14名HIV-1感染患者細(xì)胞中的活性蛋白質(zhì)。研究小組通過將患者基因表達(dá)與單個細(xì)胞內(nèi)的病毒RNA(vRNA)數(shù)量相關(guān)聯(lián),縮小了稱為宿主限制因子的潛在抗病毒蛋白列表。這些蛋白質(zhì)是人體先天免疫系統(tǒng)的一部分,可以識別并干擾病毒復(fù)制周期的特定步驟,從而阻止感染。

研究小組還比較了血漿病毒載量最高的參與者的測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)vRNA轉(zhuǎn)錄與編碼胸腺肽αα(ProTα)的基因PTMA的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。

隨后在初始研究之外的28名其他參與者中驗證了這種關(guān)聯(lián)。胸腺素α原的體外過度表達(dá)證實該細(xì)胞因子抑制HIV-1轉(zhuǎn)錄和感染性病毒的產(chǎn)生。

研究人員發(fā)現(xiàn)個體免疫細(xì)胞中的HIV-1RNA(vRNA)與特定的臨床測量結(jié)果相關(guān)。通過單細(xì)胞分析,研究人員鑒定了急性HIV感染(AHI)和抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療(ART)階段參與者的帶有vRNA的細(xì)胞。

vRNA+細(xì)胞主要存在于CD4+T細(xì)胞亞群中。相關(guān)性分析顯示,vRNA+CD4+T細(xì)胞的頻率與總細(xì)胞相關(guān)HIV-1DNA和血漿病毒載量等指標(biāo)呈正相關(guān)。這表明這些細(xì)胞中vRNA的存在具有生物學(xué)意義,并且與HIV-1臨床參數(shù)相關(guān)。

為了證實該方法,紐約西奈山醫(yī)學(xué)院的研究人員在17年前發(fā)現(xiàn)了突出顯示的ProTαHIV-1限制,并在一篇論文“ProthymosinAlpha作為人類有效抑制劑的新功能”中進(jìn)行了描述。原代巨噬細(xì)胞中的免疫缺陷病毒1型基因表達(dá),”發(fā)表在《病毒學(xué)雜志》上。

先前的研究還觀察到人類T細(xì)胞感染HIV-1與可檢測到的ProTαmRNA量減少有關(guān)。西奈山的研究發(fā)現(xiàn),ProTα活性以劑量依賴性方式顯著抑制原代巨噬細(xì)胞中的HIV-1復(fù)制,但對CD4+T細(xì)胞中的HIV-1幾乎沒有影響。

目前的研究展示了使用公正的組學(xué)技術(shù)來識別潛在的抗病毒因子,例如HIV-1的ProTα和其他病毒預(yù)防和治療策略。

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