癌細(xì)胞的 DNA 中可能有數(shù)千個(gè)突變。然而，只有少數(shù)人真正推動(dòng)了癌癥的進(jìn)展。其余的只是順路。
將這些有害的驅(qū)動(dòng)突變與中性乘客區(qū)分開(kāi)來(lái)可以幫助研究人員確定更好的藥物靶點(diǎn)。為了推動(dòng)這些努力，麻省理工學(xué)院領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)建立了一個(gè)新的計(jì)算機(jī)模型，可以快速掃描癌細(xì)胞的整個(gè)基因組，并識(shí)別出比預(yù)期更頻繁發(fā)生的突變，這表明它們正在推動(dòng)腫瘤生長(zhǎng)。這種類型的預(yù)測(cè)具有挑戰(zhàn)性，因?yàn)槟承┗蚪M區(qū)域的乘客突變頻率極高，淹沒(méi)了實(shí)際駕駛員的信號(hào)
麻省理工學(xué)院研究生 Maxwell Sherman 說(shuō)：“我們創(chuàng)建了一種概率性的深度學(xué)習(xí)方法，使我們能夠獲得一個(gè)非常準(zhǔn)確的模型，以了解應(yīng)該存在于基因組中任何地方的乘客突變數(shù)量。”“然后我們可以在整個(gè)基因組中尋找意外積累突變的區(qū)域，這表明這些是驅(qū)動(dòng)突變。”
在他們的新研究中，研究人員發(fā)現(xiàn)了基因組中的其他突變，這些突變似乎有助于 5% 到 10% 的癌癥患者的腫瘤生長(zhǎng)。研究人員說(shuō)，這些發(fā)現(xiàn)可以幫助醫(yī)生確定更有可能成功治療這些患者的藥物。目前，至少 30% 的癌癥患者沒(méi)有可用于指導(dǎo)治療的可檢測(cè)驅(qū)動(dòng)突變。
Sherman、麻省理工學(xué)院研究生 Adam Yaari 和前麻省理工學(xué)院研究助理 Oliver Priebe 是該研究的主要作者，該研究今天發(fā)表在Nature Biotechnology上。麻省理工學(xué)院 Simons 數(shù)學(xué)教授、計(jì)算機(jī)科學(xué)與人工智能實(shí)驗(yàn)室 (CSAIL) 計(jì)算與生物學(xué)組負(fù)責(zé)人 Bonnie Berger 和哈佛大學(xué)助理教授 Po-Ru Loh 是該研究的高級(jí)作者醫(yī)學(xué)院和麻省理工學(xué)院和哈佛博德研究所的準(zhǔn)成員。哈佛醫(yī)學(xué)院和波士頓兒童醫(yī)院的副教授 Felix Dietlein 也是該論文的作者。
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