現(xiàn)代尖端研究會(huì)產(chǎn)生大量數(shù)據(jù)，科學(xué)家面臨著可視化和分析這些數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn)。維爾茨堡亥姆霍茲 RNA 感染研究所 (HIRI) 和維爾茨堡-施韋因富特應(yīng)用技術(shù)大學(xué) (THWS) 的研究人員開(kāi)發(fā)了一種可視化大型數(shù)據(jù)集的工具。
sCIRCLE 工具允許用戶(hù)以交互且用戶(hù)友好的方式探索單細(xì)胞分析數(shù)據(jù)。他們的研究結(jié)果已發(fā)表在《NAR 基因組學(xué)和生物信息學(xué)》雜志上。
抗生素耐藥性在世界范圍內(nèi)不斷增加，對(duì)醫(yī)療保健系統(tǒng)構(gòu)成了重大挑戰(zhàn)。了解某些細(xì)菌如何以及為何產(chǎn)生這種防御機(jī)制的根本過(guò)程至關(guān)重要。
細(xì)菌基因表達(dá)的差異(讀取基因中的信息)可以提供線索。
細(xì)菌單細(xì)胞 RNA 測(cè)序(或稱(chēng)“scRNA-seq”)已成為分析這些變異的重要工具。該技術(shù)提供了特定時(shí)間點(diǎn)單個(gè)細(xì)胞中基因表達(dá)的詳細(xì)圖像。然而，該方法會(huì)產(chǎn)生大量數(shù)據(jù)，研究人員很難對(duì)其進(jìn)行可視化和分析。
因此，迫切需要新的方法和工具來(lái)顯示和理解這些信息。
位于維爾茨堡的亥姆霍茲 RNA 感染研究中心 (HIRI) 的研究人員(位于不倫瑞克的亥姆霍茲感染研究中心 (HZI) 與維爾茨堡大學(xué) (JMU) 的合作基地)以及維爾茨堡-施韋因富特應(yīng)用技術(shù)大學(xué) (THWS) 的設(shè)計(jì)師現(xiàn)已開(kāi)發(fā)出這樣一種工具。
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