由 UT 西南醫(yī)學(xué)中心的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了深度學(xué)習(xí)模型，以確定一組簡(jiǎn)單的規(guī)則來(lái)控制啟動(dòng)子的活動(dòng)，啟動(dòng)子是啟動(dòng)基因產(chǎn)生蛋白質(zhì)過(guò)程的 DNA 區(qū)域。
他們的研究結(jié)果發(fā)表在《科學(xué)》雜志上，可以使人們更好地理解啟動(dòng)子如何促進(jìn)基因調(diào)控。健康和疾病的
“雖然啟動(dòng)子對(duì)于每個(gè)基因的功能都是必不可少的，但我們對(duì)這些遺傳元件如何發(fā)揮作用的理解如何運(yùn)作的理解并不完整，盡管數(shù)十年的研究已經(jīng)定義了它們的許多特征。我們的研究為這些序列如何在人類和其他哺乳動(dòng)物中發(fā)揮作用提供了新的線索， ” UT 西南大學(xué) Lyda Hill 生物信息學(xué)系助理教授周健博士說(shuō)。
周博士與第一作者、周實(shí)驗(yàn)室研究生 Kseniia Dudnyk 和德克薩斯大學(xué)西南兒童醫(yī)學(xué)中心研究所前研究員 Ken Xu 博士共同領(lǐng)導(dǎo)了這項(xiàng)研究。
細(xì)胞用來(lái)執(zhí)行其活動(dòng)的蛋白質(zhì)的產(chǎn)生始于一個(gè)稱為轉(zhuǎn)錄的過(guò)程。此時(shí)，RNA 聚合酶蛋白會(huì)附著在 DNA 鏈上，并將編碼信息復(fù)制(或轉(zhuǎn)錄)到 RNA 分子中。 RNA 聚合酶附著并開(kāi)始轉(zhuǎn)錄的區(qū)域稱為啟動(dòng)子。
在人類中，啟動(dòng)子通常由數(shù)百個(gè)堿基對(duì)(構(gòu)成 DNA 的單位)組成。盡管研究人員已經(jīng)確定了一些 DNA 啟動(dòng)子區(qū)域共享的共同堿基對(duì)序列，但這些序列在人類啟動(dòng)子中通常不存在，使得 DNA 序列如何指導(dǎo)轉(zhuǎn)錄過(guò)程的規(guī)則尚不清楚。
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