通過(guò)加強(qiáng)對(duì)未知蛋白質(zhì)的關(guān)注來(lái)加速研究。
英國(guó)研究人員開(kāi)發(fā)了一個(gè)新的可公開(kāi)訪(fǎng)問(wèn)的數(shù)據(jù)庫(kù)，他們希望看到它隨著時(shí)間的推移而縮小。這是因?yàn)樗侨祟?lèi)基因組中基因編碼的數(shù)千種尚未研究的蛋白質(zhì)的概要，這些蛋白質(zhì)的存在是已知的，但其功能大多未知。
該數(shù)據(jù)庫(kù)被稱(chēng)為“unknome”，是英國(guó)牛津大學(xué)鄧恩病理學(xué)院的 Matthew Freeman和英國(guó)劍橋 MRC 分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的 Sean Munro 及其同事的成果，并在開(kāi)放獲取期刊 PLOS Biology。他們自己對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)中一部分蛋白質(zhì)的研究表明，大多數(shù)蛋白質(zhì)有助于重要的細(xì)胞功能，包括發(fā)育和抗壓能力。
人類(lèi)基因組的測(cè)序清楚地表明，它編碼了數(shù)千種可能的蛋白質(zhì)序列，但其身份和功能仍然未知。造成這種情況的原因有多種，包括傾向于將稀缺的研究資金集中在已知的目標(biāo)上，以及缺乏包括抗體在內(nèi)的工具來(lái)詢(xún)問(wèn)細(xì)胞這些蛋白質(zhì)的功能。
但作者認(rèn)為，忽視這些蛋白質(zhì)的風(fēng)險(xiǎn)很大，因?yàn)楹芸赡芷渲幸恍┑鞍踪|(zhì)，也許是許多蛋白質(zhì)，在關(guān)鍵細(xì)胞過(guò)程中發(fā)揮重要作用，并且可能為治療干預(yù)提供見(jiàn)解和目標(biāo)。
為了促進(jìn)對(duì)此類(lèi)蛋白質(zhì)的更快速探索，作者創(chuàng)建了unknome 數(shù)據(jù)庫(kù)，為每種蛋白質(zhì)分配一個(gè)“已知”分?jǐn)?shù)，反映科學(xué)文獻(xiàn)中有關(guān)功能、跨物種保護(hù)、亞細(xì)胞區(qū)劃和其他元素的信息。
基于這個(gè)系統(tǒng)，有數(shù)千種蛋白質(zhì)的已知度接近于零。包括來(lái)自模型生物體的蛋白質(zhì)以及來(lái)自人類(lèi)基因組的蛋白質(zhì)。該數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)所有人開(kāi)放并且可定制，允許用戶(hù)為不同元素提供自己的權(quán)重，從而生成自己的一組已知分?jǐn)?shù)來(lái)優(yōu)先考慮自己的研究。
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