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數(shù)據(jù)驅(qū)動科學(xué)的開源工具

導(dǎo)讀 知識共享是科學(xué)進(jìn)步的重要?jiǎng)恿ΑPFL的“藍(lán)色大腦項(xiàng)目”采用開放的科學(xué)方法創(chuàng)建并開源“藍(lán)色大腦Nexus”,允許構(gòu)建數(shù)據(jù)集成平臺。Blue B

知識共享是科學(xué)進(jìn)步的重要?jiǎng)恿?。EPFL的“藍(lán)色大腦項(xiàng)目”采用開放的科學(xué)方法創(chuàng)建并開源“藍(lán)色大腦Nexus”,允許構(gòu)建數(shù)據(jù)集成平臺。Blue Brain Nexus通過搜索、集成和跟蹤大規(guī)模數(shù)據(jù)和模型,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)驅(qū)動的科學(xué)。

EPFL的藍(lán)色大腦項(xiàng)目宣布發(fā)布其開源軟件項(xiàng)目“藍(lán)色大腦連接系統(tǒng)”,旨在實(shí)現(xiàn)神經(jīng)科學(xué)和更廣泛的科學(xué)界的公平(可搜索、可訪問、可互操作和可重用)數(shù)據(jù)管理原則。它是EPFL開放科學(xué)計(jì)劃的一部分,旨在最大限度地?cái)U(kuò)大學(xué)校研究的范圍和影響。

藍(lán)腦項(xiàng)目的目的是為嚙齒類動物的大腦以及最終人類的大腦建立精確的、生物學(xué)上詳細(xì)的數(shù)字重建和模擬。Blue Brain Nexus在支持Blue Brain數(shù)據(jù)驅(qū)動建模周期的所有階段發(fā)揮作用,包括但不限于實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、單細(xì)胞模型、電路、仿真和驗(yàn)證。大腦是一個(gè)復(fù)雜的多層次系統(tǒng),也是我們今天最大的“大數(shù)據(jù)”問題之一。因此,Blue Brain Nexus旨在組織、存儲和處理異常大量的數(shù)據(jù),并支持大量用戶的使用。

Blue Brain Nexus的核心是知識地圖,作為數(shù)據(jù)倉庫和元數(shù)據(jù)目錄。通過允許用戶設(shè)計(jì)任何領(lǐng)域,它仍然獨(dú)立于要表示的領(lǐng)域,這使得其他科學(xué)程序(如天文學(xué)、醫(yī)學(xué)研究和農(nóng)業(yè))能夠使用Blue Brain Nexus作為其數(shù)據(jù)平臺的核心。藍(lán)腦Nexus服務(wù)已經(jīng)在評估是否可以集成到人腦項(xiàng)目的神經(jīng)信息學(xué)平臺中。

Blue Brain Nexus的知識圖譜致力于科學(xué)進(jìn)步的貢獻(xiàn),其起源被視為一等公民,從而推動了對數(shù)據(jù)源和使用模式的追蹤。這使用戶能夠評估數(shù)據(jù)質(zhì)量,從而建立信任。Blue Brain Nexus的另一個(gè)關(guān)鍵功能是它的語義搜索功能,可以將搜索與數(shù)據(jù)及其來源整合在一起,讓科學(xué)家可以輕松發(fā)現(xiàn)和訪問新的相關(guān)數(shù)據(jù)。

EPFL大學(xué)教授肖恩希爾說:“我們看到幾乎所有的科學(xué)都是由數(shù)據(jù)主導(dǎo)的。Blue Brain Nexus代表了多年的研究成果,旨在構(gòu)建最先進(jìn)的語義數(shù)據(jù)管理平臺。我們迫不及待地想看看社區(qū)將如何使用Blue Brain Nexus?!?

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