威康桑格研究所、大奧蒙德街醫(yī)院 (GOSH)、馬克西瑪公主小兒腫瘤中心和 Oncode 研究所的研究人員已經(jīng)確定了七種腎癌的起源,包括幾種罕見的亞型。研究結(jié)果證實(shí),這些癌癥起源于成熟胎兒中存在的特定形式的發(fā)育細(xì)胞。
該研究于今天(2021 年 6 月 23 日)發(fā)表在Nature Communications 上,使用計(jì)算方法來分析現(xiàn)有數(shù)據(jù)集,并確定不同癌癥出現(xiàn)時(shí)發(fā)出的“細(xì)胞信號(hào)”。這種方法有望成為診斷罕見癌癥患者的工具——在這項(xiàng)研究中,一名患者的隱匿性腎癌通過觀察其細(xì)胞信號(hào)被確定為維爾姆斯樣腫瘤。
所有癌癥都源自于開始不受控制地繁殖的正常細(xì)胞。通過比較癌癥和正常細(xì)胞中基因表達(dá)的模式,可以了解每個(gè)腫瘤的起源和行為的各個(gè)方面。單細(xì)胞 mRNA 測序的出現(xiàn)使這種類型的分析成為可能,這是一種高分辨率技術(shù),可以根據(jù)單個(gè)細(xì)胞表達(dá)的基因識(shí)別組織中存在的不同細(xì)胞類型。
以前的研究已經(jīng)使用這些技術(shù)來比較一些最常見的腎癌的正常組織和患病組織,但無法對數(shù)百個(gè)腫瘤進(jìn)行單細(xì)胞測序。
在這項(xiàng)研究中,Wellcome Sanger 研究所的研究人員及其合作者轉(zhuǎn)向計(jì)算技術(shù)來挖掘人類細(xì)胞圖譜 (HCA) 參考數(shù)據(jù)和腫瘤基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫。他們評估了 1,300 個(gè)兒童和成人腎臟腫瘤中的 mRNA 信號(hào),跨越七種不同的腫瘤類型,以研究這些癌癥的起源。
結(jié)果證實(shí),這些兒童癌癥起源于發(fā)育,發(fā)生在特定發(fā)育細(xì)胞類型的成熟過程中出現(xiàn)錯(cuò)誤之后。相比之下,成人腎癌來自成熟的細(xì)胞類型,并且在絕大多數(shù)情況下不會(huì)恢復(fù)到基因表達(dá)的發(fā)育模式。
還發(fā)現(xiàn)每種癌癥類型都表現(xiàn)出獨(dú)特的“細(xì)胞信號(hào)”或基因表達(dá)模式,未來可用于對其進(jìn)行分類。
標(biāo)簽: 腎癌
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