威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們開發(fā)了一種計算技術(shù),可以大大提高原子力顯微鏡的分辨率,原子力顯微鏡是一種“感覺”表面原子的特殊類型的顯微鏡。該方法揭示了正常生理條件下蛋白質(zhì)和其他生物結(jié)構(gòu)的原子級細(xì)節(jié),為細(xì)胞生物學(xué)、病毒學(xué)和其他微觀過程打開了一個新窗口。
在 6 月 16 日發(fā)表在《自然》雜志上的一項研究中,研究人員描述了這項新技術(shù),該技術(shù)基于一種用于提高光學(xué)顯微鏡分辨率的策略。
為了以高分辨率研究蛋白質(zhì)和其他生物分子,研究人員長期以來一直依賴兩種技術(shù):X 射線晶體學(xué)和冷凍電子顯微鏡。雖然這兩種方法都可以確定分子結(jié)構(gòu),直到單個原子的分辨率,但它們是在分子支架上確定的,或者在超低溫下冷凍,可能會改變它們的正常生理形狀。原子力顯微鏡(AFM)可以在正常生理條件下分析生物分子,但所得圖像模糊且分辨率低。
“原子力顯微鏡可以輕松解析物理學(xué)中、硅酸鹽固體表面和半導(dǎo)體上的原子,因此這意味著機(jī)器原則上具有做到這一點的精度,”資深作者、生理學(xué)和生物物理學(xué)教授 Simon Scheuring 博士說。威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院的麻醉學(xué)。“這項技術(shù)有點像你拿筆掃描落基山脈,這樣你就能得到物體的地形圖。實際上,我們的筆是一根針,鋒利到幾個原子,而物體是單個蛋白質(zhì)分子。”
然而,生物分子有許多擺動的小部分,模糊了它們的 AFM 圖像。為了解決這個問題,Scheuring 博士和他的同事們采用了一種來自光學(xué)顯微鏡的概念,稱為超分辨率顯微鏡。“從理論上講,光學(xué)顯微鏡不可能分辨距離小于光波長一半的兩個熒光分子,”他說。然而,通過刺激相鄰分子在不同時間發(fā)出熒光,顯微鏡師可以分析每個分子的擴(kuò)散并高精度地確定它們的位置。
Scheuring 博士的團(tuán)隊指出,在 AFM 掃描過程中記錄的生物分子的自然波動產(chǎn)生了類似的位置數(shù)據(jù)傳播,而不是刺激熒光。第一作者 George Heath 博士,在研究時是威爾康奈爾醫(yī)學(xué)院的博士后助理,現(xiàn)在是利茲大學(xué)的教員,從事實驗和計算模擬的循環(huán),以更深入地了解 AFM 成像過程。從尖端和樣品之間的原子相互作用中詳細(xì)提取并提取最大信息。
使用超分辨率分析等方法,他們能夠提取運動分子的更高分辨率圖像。繼續(xù)地形類比,Scheuring 博士解釋說,“如果巖石(即原子)上下擺動一點,你可以檢測到這個,然后那個,然后你隨著時間的推移對所有檢測進(jìn)行平均,你會收到高 -分辨率信息。”
標(biāo)簽: 原子尺度
免責(zé)聲明:本文由用戶上傳,如有侵權(quán)請聯(lián)系刪除!