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新方法擴展了小RNA的領域

導讀 加利福尼亞州河濱市-由加利福尼亞大學河濱分校的生物醫(yī)學科學家領導的團隊開發(fā)了一種新的RNA測序方法-通過克服RNA修飾終止測序全景顯示RNA

加利福尼亞州河濱市-由加利福尼亞大學河濱分校的生物醫(yī)學科學家領導的團隊開發(fā)了一種新的RNA測序方法-“通過克服RNA修飾終止測序全景顯示RNA”或PANDORA-seq??梢詭椭l(fā)現(xiàn)許多以前無法檢測到的修飾小RNA。

RNA在解碼DNA的遺傳信息以維持生物體的生命中起著核心作用。通常被稱為用于從DNA合成蛋白質的中間分子。細胞充滿了復雜而多樣形式的RNA分子,兩種主要類型是核糖體RNA或rRNA。并轉移RNA或tRNA;它們參與蛋白質的合成。

小RNA在包括癌癥,糖尿病,神經(jīng)系統(tǒng)疾病和不育癥在內(nèi)的健康和疾病中起著至關重要的作用。小RNA的例子是microRNA;piwi相互作用RNA,或piRNA;以及源自tRNA的小RNA或tsRNA。小RNA可以被化學基團修飾,從而獲得新功能。

高通量RNA測序技術的發(fā)展(可用于檢查生物樣品中RNA的數(shù)量和序列),發(fā)現(xiàn)了不斷擴大的小RNA種群,這些種群可微調基因表達并保護基因組。

UCR醫(yī)學院生物醫(yī)學科學助理教授Qi Chen表示:“ PANDORA-seq可廣泛用于在各種生理和疾病條件下描繪小RNA的概況,以促進發(fā)現(xiàn)與這些條件有關的關鍵調控小RNA的發(fā)現(xiàn)。”,誰領導的研究今天發(fā)表Nature Cell Biology上。“修飾的小RNA帶有'隱形斗篷',可防止其被傳統(tǒng)的RNA測序方法檢測到。其中有多少個此類修飾的RNA?其序列的起源是什么?它們的生物學功能究竟是什么?這些都是問題。 PANDORA-seq也許可以回答。”

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