(田納西州孟菲斯-2020年10月14日)研究人員利用神經(jīng)母細胞瘤綜合基因組分析的見解，了解了導(dǎo)致兒童最常見的實體瘤之一的過程。這些結(jié)果揭示了開發(fā)精確藥物以改善患者預(yù)后的可能方法。圣裘德兒童研究醫(yī)院的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)了這項研究，該研究發(fā)表在今天的《自然通訊》雜志上。
對702例神經(jīng)母細胞瘤標本進行了全基因組、外顯子和轉(zhuǎn)錄組測序分析。包括來自復(fù)發(fā)患者的23個樣本。這項工作確定了研究人員希望通過治療使用的常見突狀之間的關(guān)聯(lián)。
“這是對大量腫瘤的綜合分析，有助于了解神經(jīng)母細胞瘤中以前未被認識到的相關(guān)性，找到罕見的驅(qū)動基因突變，”圣裘德氏病科對應(yīng)作者張景輝博士說。計算生物學(xué)。
通信作者是圣裘德發(fā)育神經(jīng)生物學(xué)部主任、霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員、邁克爾戴爾博士和費城兒童醫(yī)院醫(yī)學(xué)博士邁克爾霍加蒂。
常見突變和氧化應(yīng)激的連接點
研究人員使用一種類似指紋的常見突變模式來識別促進腫瘤生長和擴散的內(nèi)部過程。研究人員知道，神經(jīng)母細胞瘤中稱為活性氧和氧化應(yīng)激的脫氧核糖核酸損傷分子會增加?；钚匝踉诩毎木€粒體中產(chǎn)生。分析表明，65%的神經(jīng)母細胞瘤染色體突變與脫氧核糖核酸損傷分子相關(guān)。這些腫瘤有一條額外的17號染色體。這部分包括在線粒體中表達的基因。結(jié)果表明，線粒體基因缺陷可能導(dǎo)致活性氧產(chǎn)生增加，從而加重腫瘤的生長和耐藥性。
圣裘德云對39種癌癥類型的1000多個兒科腫瘤基因組的搜索發(fā)現(xiàn)，這種關(guān)聯(lián)并不是唯一的。研究人員報告稱，來自另一種癌癥(橫紋肌肉瘤)的樣本中，超過20%的樣本線粒體基因表達增加，氧化應(yīng)激增加。這一發(fā)現(xiàn)加強了新發(fā)現(xiàn)的線粒體基因缺陷和突變過程之間的聯(lián)系。
戴爾說：“通過這一分析，我們對驅(qū)動神經(jīng)母細胞瘤的變化有了更深入的了解，包括腫瘤的形成、進展和對治療的反應(yīng)?！薄斑@是轉(zhuǎn)化研究的基礎(chǔ)?！?
神經(jīng)母細胞瘤預(yù)測因子
神經(jīng)母細胞瘤發(fā)生在胎兒神經(jīng)細胞中，稱為神經(jīng)母細胞瘤，不能正常成熟。雖然7-10%的兒童癌癥是神經(jīng)母細胞瘤，但它占嬰兒所有癌癥的一半。癌癥通常始于腎上腺，但也可能始于胸部、脊柱或脊髓區(qū)域、腹部和其他區(qū)域。
而且治療方法和結(jié)果因患者年齡而異。最年輕患者(小于18個月)的存活率約為95%。對于老年和高?；颊?，生存率只有50%左右。
這項研究加強了患者年齡和導(dǎo)致疾病的突變之間的關(guān)系。例如，基因MYCN和TERT通常在3.8歲或更小的患者中發(fā)生變化，而ATRX突變在中位年齡為5.6歲的兒童中更為常見。
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