CTCF 是一種轉(zhuǎn)錄因子，因其在調(diào)節(jié)稱為MYC的關(guān)鍵癌基因中的作用而成為研究目標(biāo)。圣裘德兒童研究醫(yī)院的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了直接證據(jù)，表明 CTCF 控制著染色質(zhì)的可及性，即打開(kāi)緊密纏繞的 DNA 以便表達(dá)基因的過(guò)程。研究結(jié)果發(fā)表在基因組生物學(xué)上。
CTCF 被生物學(xué)家稱為基因組的主要調(diào)節(jié)器，并因嚴(yán)重影響基因組的 3D 結(jié)構(gòu)而聞名。導(dǎo)致其缺失的 CTCF 突變很少見(jiàn);然而，影響它如何與基因和蛋白質(zhì)結(jié)合的突變?cè)诨加邪┌Y等疾病的細(xì)胞中很常見(jiàn)。雖然對(duì) CTCF 對(duì)基因的下游影響進(jìn)行了深入研究，但對(duì)更直接的影響知之甚少。
“我們對(duì) CTCF 的直接作用的認(rèn)識(shí)存在空白，這對(duì)于理解轉(zhuǎn)錄過(guò)程很重要，”資深和共同通訊作者李春良博士說(shuō)，圣裘德腫瘤細(xì)胞生物學(xué)系.“如果你在正確的時(shí)間和地點(diǎn)改變基因表達(dá)，那么即使是適度的轉(zhuǎn)錄變化也會(huì)導(dǎo)致疾病發(fā)展發(fā)生重大變化。”
新技術(shù)引領(lǐng)潮流
研究人員使用尖端技術(shù)和多學(xué)科方法，利用生長(zhǎng)素誘導(dǎo)的 degron 系統(tǒng)。生長(zhǎng)素誘導(dǎo)的 degron 系統(tǒng)是一種在短時(shí)間內(nèi)以靶向方式降解蛋白質(zhì)的技術(shù)，使研究人員能夠更好地了解其主要功能。這些工具對(duì)于研究 CTCF 蛋白的急性消耗如何影響細(xì)胞是必要的。
“區(qū)分 CTCF 的真正生物學(xué)具有挑戰(zhàn)性，但我們已經(jīng)使用這些工具提供了直接證據(jù)，證明 CTCF 調(diào)節(jié)染色質(zhì)的可及性，并為該領(lǐng)域提供清晰度，”共同第一和共同通訊作者徐北思博士說(shuō)。 .D.，圣裘德應(yīng)用生物信息學(xué)中心。
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