Polycomb 抑制復(fù)合物 2 (PRC2) 最初在幾十年前在果蠅中發(fā)現(xiàn),被發(fā)現(xiàn)是發(fā)育基因的關(guān)鍵控制器。隨后的研究表明,PRC2 通過(guò)改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu)來(lái)抑制特定基因的表達(dá)。
當(dāng)發(fā)現(xiàn) PRC2 在不發(fā)生發(fā)育的單細(xì)胞生物體中活躍時(shí),對(duì) PRC2 祖先功能(主要在發(fā)育過(guò)程中控制基因)的最初理解受到了挑戰(zhàn)。
PRC2 的祖先角色和演變
關(guān)于 PRC2 最初作用的第一個(gè)線索來(lái)自對(duì)紅藻的研究,該研究發(fā)現(xiàn) PRC2 在轉(zhuǎn)座子(在基因組中移動(dòng)的跳躍基因)上留下了甲基化標(biāo)記。Frederic Berger 和他在格雷戈?duì)?middot;孟德?tīng)柗肿又参锷飳W(xué)研究所 (GMI) 的研究小組決定遵循這一線索,并與柏林自由大學(xué)、劍橋大學(xué)、南特大學(xué)、國(guó)家遺傳學(xué)研究所(日本)的研究人員進(jìn)行國(guó)際合作)和莫納什大學(xué)研究了 PRC2 在一系列真核生物中的作用。
為了了解 PRC2 在真核生物祖先中的作用,研究人員研究了三個(gè)相距甚遠(yuǎn)的真核生物譜系的基因組:植物、SAR 和后康生物(人類(lèi)和真菌所屬的譜系)。
所有這些真核生物都含有轉(zhuǎn)座子,即可以從DNA中切除自身并插入到新位置的移動(dòng)遺傳元件,這對(duì)基因組穩(wěn)定性構(gòu)成潛在威脅,因此必須沉默轉(zhuǎn)座子。在突變硅藻、苔蘚植物和紅藻中,PRC2 活性的去除導(dǎo)致轉(zhuǎn)座元件沉默的喪失。
“這些發(fā)現(xiàn)表明 PRC2 抑制這些遙遠(yuǎn)譜系中的轉(zhuǎn)座因子,這將其定義為所有三個(gè)譜系的祖先中出現(xiàn)的功能。PRC2的起源可能主要是為了保護(hù)基因組免受轉(zhuǎn)座子的入侵。這種祖先功能是范式的深刻變化,”GMI 小組組長(zhǎng)、該研究的通訊作者 Frederic Berger 說(shuō)。
然而,在進(jìn)化過(guò)程中,PRC2 的功能逐漸從抑制轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)變?yōu)橐种频鞍踪|(zhì)編碼基因,這也是其最初描述的作用。在陸地植物中,研究人員發(fā)現(xiàn)“化石 TE”仍然是 PRC2 的目標(biāo),然后 PRC2 就會(huì)沉默附近的基因。
Berger 小組的博士后研究員、該研究的第一作者 Tetsuya Hisanaga 解釋說(shuō):“在開(kāi)花植物中,比如最近才進(jìn)化的擬南芥,TE 的殘余物仍然存在,并招募 PRC2 來(lái)沉默附近的基因。” “我們假設(shè)在擬南芥中,一些 TE 已經(jīng)被馴化,成為參與調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)編碼基因的元件。”
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