今天發(fā)表在《開(kāi)放獲取雜志》上的GigaScience是一篇介紹tegu蜥蜴基因組的文章，它掌握了爬行動(dòng)物世界中一項(xiàng)非常不尋常的技能：它可以打開(kāi)自己的加熱系統(tǒng)。
大多數(shù)爬行動(dòng)物不能像哺乳動(dòng)物一樣控制自己的體溫，而必須依靠自己所處的環(huán)境，比如可用的陽(yáng)光和陰影，才能獲得最佳的體溫。然而，薩爾瓦托梅里阿納(Salvator merianae)的特古(Tegu)向血液全面變暖邁出了一步：它可以將體溫提高到比周圍環(huán)境高10攝氏度。tegu的另一個(gè)更消極的方面是入侵物種，這對(duì)瀕危物種構(gòu)成了嚴(yán)重威脅。雖然它是土生土長(zhǎng)的南美雨林和稀樹(shù)草原，但它迷人的本質(zhì)——它甚至可以達(dá)到一定程度的室內(nèi)訓(xùn)練，這使它成為一種非常迷人的寵物，深受爬行動(dòng)物愛(ài)好者的喜愛(ài)。不幸的是，外來(lái)寵物的國(guó)際貿(mào)易是物種進(jìn)入新環(huán)境的主要原因之一，在新環(huán)境中，它們可能會(huì)成為當(dāng)?shù)匚锓N的威脅。鑒于tegu獨(dú)特的生物特性及其對(duì)環(huán)境的潛在危險(xiǎn)，
德國(guó)德累斯頓馬克斯普朗克分子細(xì)胞生物學(xué)和遺傳學(xué)研究所的邁克爾希勒領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)提供的tegu基因組序列質(zhì)量前所未有。為了實(shí)現(xiàn)這一目標(biāo)，研究人員使用最先進(jìn)的技術(shù)讀取tegu的DNA并組裝其基因組序列。最新發(fā)布的梅里阿納氏菌基因組序列長(zhǎng)度超過(guò)20億個(gè)DNA字母，包含22000多個(gè)基因。這是迄今為止所有爬行動(dòng)物基因組中最完整的組裝，也將幫助科學(xué)家研究其他蜥蜴和蛇。
通過(guò)使用所謂的“太平洋生物科學(xué)”測(cè)序技術(shù)，研究人員可以克服爬行動(dòng)物基因組組裝中的一些挑戰(zhàn)。Hiller和第一作者Juliana Roscito解釋說(shuō)：“像其他爬行動(dòng)物一樣，tegu基因組的很大一部分由重復(fù)序列組成，這些序列在基因組中出現(xiàn)了很多次。重復(fù)組裝是基因組組裝中的一個(gè)主要問(wèn)題，尤其是當(dāng)重復(fù)序列比測(cè)序的DNA片段的長(zhǎng)度更長(zhǎng)時(shí)，會(huì)導(dǎo)致組裝中的間隙(斷裂)?！?
Tegu本身就是一個(gè)有趣的模式物種。作者對(duì)tegu基因組測(cè)序的動(dòng)機(jī)之一實(shí)際上與他們對(duì)另一類爬行動(dòng)物的興趣有關(guān)：蛇。作者解釋了他們的想法：“我們對(duì)研究蛇和其他爬行動(dòng)物的斷肢感興趣。因?yàn)闆](méi)有四肢的爬行動(dòng)物的祖先有完全發(fā)育的四肢，所以我們需要一個(gè)組裝良好的四肢完全發(fā)育的蜥蜴基因組作為參考”。由于具有測(cè)序基因組的爬行動(dòng)物很少，作者決定自己生產(chǎn)它們。
本文的另一部分，特別考慮到爬行動(dòng)物缺乏代表性。作為基因組測(cè)序的脊椎動(dòng)物，作者還提供了tegu與其他16個(gè)物種的全基因組比較。“我們希望這些資源能夠促進(jìn)比較爬行動(dòng)物基因組學(xué)，從而了解這個(gè)物種獨(dú)特的形態(tài)特征是如何進(jìn)化的，以及脊椎動(dòng)物基因組是如何進(jìn)化的，”Michael Hiller和Juliana Roscito總結(jié)道。
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