生物標(biāo)志物通常在癌癥管理過(guò)程中用于指導(dǎo)治療決策和預(yù)測(cè)患者預(yù)后。然而，通常很難確定合適的生物標(biāo)志物，這些生物標(biāo)志物可以始終如一地復(fù)制，并且很容易用有限的患者樣本進(jìn)行分析。在 5 月 1 日《癌癥研究》雜志封面上的一項(xiàng)新研究中，莫菲特癌癥中心的研究人員報(bào)告了他們基于一種稱為甲基化的基因修飾來(lái)識(shí)別生物標(biāo)志物，這種基因修飾可以預(yù)測(cè)腫瘤免疫環(huán)境的類型和患者的預(yù)后。
基因受到可以促進(jìn)或阻止其表達(dá)的特定修飾的高度調(diào)節(jié)。一種稱為甲基化的表觀遺傳修飾涉及將甲基化學(xué)基團(tuán)連接到基因的特定區(qū)域。通常，基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化水平較高往往與較低的基因表達(dá)水平相關(guān)。最近，研究表明遺傳甲基化模式可能是潛在的生物標(biāo)志物。使用甲基化作為生物標(biāo)志物與常用的基因表達(dá)生物標(biāo)志物相比具有幾個(gè)優(yōu)點(diǎn)，包括使其易于在臨床環(huán)境中使用的可重復(fù)性和穩(wěn)定性，不同測(cè)試技術(shù)之間的差異較小，并且能夠使用冷凍或固定在甲醛中并包埋在石蠟中的組織樣本。
目前，溶細(xì)胞活性評(píng)分是一種成熟的生物標(biāo)志物，可根據(jù)基因表達(dá)預(yù)測(cè)腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞的存在。腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞是一種已從血液中移出并進(jìn)入腫瘤的免疫細(xì)胞。腫瘤中大量腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞的存在通常與患者預(yù)后的改善有關(guān)。溶細(xì)胞活性評(píng)分通過(guò)測(cè)量基因表達(dá)模式來(lái)預(yù)測(cè)腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞的存在，特別是細(xì)胞毒性 T 細(xì)胞。
在他們的研究中，Moffitt 研究人員希望找到比常用生物標(biāo)志物更好的生物標(biāo)志物，例如溶細(xì)胞活性評(píng)分(用于識(shí)別熱/冷腫瘤)。他們提出了基于腫瘤的表達(dá)數(shù)量性狀甲基化的概念，該概念將基因甲基化模式與基因表達(dá)相關(guān)聯(lián)，以識(shí)別潛在的生物標(biāo)志物。研究人員將黑色素瘤作為一種疾病模型進(jìn)行了研究，并評(píng)估了他們是否可以識(shí)別出一種特定的甲基化特征，該特征可以預(yù)測(cè)腫瘤的免疫環(huán)境和患者的預(yù)后。
研究小組發(fā)現(xiàn)，黑色素瘤樣本中的甲基化序列可以作為細(xì)胞溶解活性評(píng)分的替代生物標(biāo)志物，并預(yù)測(cè)腫瘤中免疫環(huán)境的類型。通過(guò)進(jìn)行更有針對(duì)性的分析，他們確定稱為 TCF7 的單個(gè)基因的甲基化可以預(yù)測(cè)腫瘤中的 T 細(xì)胞是否具有抗腫瘤特性，并且他們發(fā)現(xiàn) TCF7 特征與溶細(xì)胞活性評(píng)分相結(jié)合可以預(yù)測(cè)患者的預(yù)后。具體而言，具有低 TCF7 特征和高溶細(xì)胞活性評(píng)分的黑色素瘤患者比其他特征組合具有更長(zhǎng)的生存期。研究人員證實(shí)了其他腫瘤類型(包括腎癌、食管癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤、肉瘤和肺癌)中低 TCF7/高溶細(xì)胞活性評(píng)分之間的關(guān)??聯(lián).此外，研究人員確定 TCF7 簽名可以獨(dú)立于其他變量預(yù)測(cè)患者結(jié)果。
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