但很長(zhǎng)一段時(shí)間以來(lái),科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)將細(xì)菌細(xì)胞視為“平均”是很方便的。
傳統(tǒng)上,研究人員依靠種群水平的策略來(lái)了解細(xì)菌生理學(xué)的基本方面。這些種群水平的方法描述了理想化平均細(xì)胞的行為,它們是細(xì)菌生長(zhǎng)的主流模型的基礎(chǔ)。
基于平均細(xì)胞的模型很有用,但它們可能無(wú)法準(zhǔn)確描述單個(gè)細(xì)胞的實(shí)際工作方式。單細(xì)胞活體成像技術(shù)的出現(xiàn)開(kāi)辟了新的可能性?,F(xiàn)在可以窺探單個(gè)細(xì)胞的生命。在PLOS Genetics的一篇新論文中,來(lái)自圣路易斯華盛頓大學(xué)和普渡大學(xué)的一組生物學(xué)家和物理學(xué)家使用實(shí)際的單細(xì)胞數(shù)據(jù)創(chuàng)建了一個(gè)更新的框架,用于理解細(xì)菌中細(xì)胞生長(zhǎng)、DNA 復(fù)制和分裂之間的關(guān)系系統(tǒng)。
Petra Levin 是華盛頓大學(xué)藝術(shù)與科學(xué)學(xué)院的 George William 和 Irene Koechig Freiberg 生物學(xué)教授,也是這篇新論文的作者,她對(duì)單細(xì)胞生物學(xué)有著濃厚的興趣。在她的研究工作中,萊文對(duì)我們對(duì)細(xì)菌細(xì)胞生長(zhǎng)的理解做出了開(kāi)創(chuàng)性的貢獻(xiàn)。
在阿斯彭物理中心的一次偶然相遇促成了與 Srividya Iyer-Biswas 的合作,Srividya Iyer-Biswas 是普渡大學(xué)的物理學(xué)家,在基于第一性原理的物理理論和高精度單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)方面具有專(zhuān)業(yè)知識(shí)。
利用大流行初期帶來(lái)的 Zoom 時(shí)代,Levin 和 Iyer-Biswas 開(kāi)展了他們的虛擬合作,以重新審視一些“細(xì)菌細(xì)胞周期的美麗、經(jīng)典模型”,正如 Levin 所描述的那樣。
他們發(fā)現(xiàn)缺少令人興奮的部分。
問(wèn)題是什么?這些模型依賴(lài)于群體中“平均”細(xì)胞的行為。但是使用平均值來(lái)推斷實(shí)際細(xì)胞的行為可能會(huì)產(chǎn)生誤導(dǎo)。
“想象一下,每一種細(xì)菌都在按照自己的節(jié)奏唱著自己異想天開(kāi)的曲子,”Iyer-Biswas 說(shuō)。“集體——由數(shù)百萬(wàn)個(gè)細(xì)胞組成的群體——有自己的音樂(lè),沒(méi)有任何一個(gè)聲音特別突出,但一首歌還是出現(xiàn)了。僅僅聽(tīng)到集體的演繹,一個(gè)人怎么可能發(fā)現(xiàn)一個(gè)人的歌到底能表達(dá)什么?是嗎?這就是我們面臨的問(wèn)題。”
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