阿拉巴馬大學伯明翰分校的研究人員在Immunity雜志上發(fā)表的一項研究報告稱，同類小鼠品系——在免疫學研究中使用了數(shù)十年，并被認為在標記位點之外具有相同的基因——被發(fā)現(xiàn)含有以前未被識別的遺傳變異。
由免疫學家 Amy Weinmann 博士和第一作者 Danielle Chisolm 博士領導的團隊在對影響進行實驗后發(fā)現(xiàn)了這種遺傳變異。 T 細胞上微生物代謝物的研究給出了相互矛盾的數(shù)據(jù)，并引發(fā)了令人煩惱的問題。
“我們意識到一個未知的實驗變量正在影響我們結果的解釋，”UAB 微生物學系教授 Weinmann 說。“那時，我們將重點轉移到識別那個未知變量上。如果你把研究看作是一個謎題，我們就知道我們錯過了一個關鍵的拼圖，如果不先找到我們就不能再進一步了丟失的部分。”
為了找到答案，UAB 的研究人員采用了現(xiàn)有的信息學工具并設計了一種新策略來識別與最常用的小鼠遺傳背景不同的基因組區(qū)域。他們的新方法將幫助研究人員在感興趣的染色體區(qū)域識別和定義小鼠品系之間的遺傳變異。
在這項研究中，Weinmann 及其同事分析了幾種被認為在基因標記位點 CD45 之外具有相同基因的小鼠品系。令他們驚訝的是，他們發(fā)現(xiàn)基因組的大部分區(qū)域都包含遺傳變異。這表明這些常用小鼠品系中的遺傳內容可能不是研究人員長期以來假設的那樣，這可能會影響對這些小鼠模型生成的數(shù)據(jù)的解釋。
“差異包括包含在免疫細胞歸巢、T 細胞耗竭、T 和 B 細胞分化以及先天免疫反應中具有免疫學重要性的基因的區(qū)域，”Weinmann 說。此外，CD45 基因周圍遺傳物質變異的數(shù)量和位置在三個主要的生物醫(yī)學研究小鼠供應商銷售的品系中有所不同。因此，UAB 研究的影響遠遠超出了他們最初的微生物組實驗，它提醒使用小鼠模型的研究人員在他們的實驗中注意一個意想不到的變量。
因此，該研究為研究人員提供了有關免疫學研究中廣泛使用的小鼠模型的遺傳內容的寶貴信息。重要的是，它還提供了一種新策略，研究人員可以使用該策略來定義任何小鼠模型中具有遺傳變異的區(qū)域。
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