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研究對(duì) 2,658 個(gè)腫瘤的分析為癌癥突變提供了新的線索

導(dǎo)讀 KU Leuven 和弗朗西斯·克里克研究所進(jìn)行的一項(xiàng)大規(guī)模研究表明,21% 的腫瘤具有雙突變,其中完全相同的字母在您的 DNA 的母本和父本拷

KU Leuven 和弗朗西斯·克里克研究所進(jìn)行的一項(xiàng)大規(guī)模研究表明,21% 的腫瘤具有雙突變,其中完全相同的字母在您的 DNA 的母本和父本拷貝中都發(fā)生了突變。這是一個(gè)以前在分析腫瘤時(shí)沒有考慮到的觀察結(jié)果,但對(duì)于未來癌癥研究突變的起源及其在癌癥發(fā)展中的生物學(xué)意義很重要。研究結(jié)果發(fā)表在《自然遺傳學(xué)》上。

我們的 DNA 可以被認(rèn)為是一本很大的食譜書,只有 4 個(gè)不同的字母(A、C、G 和 T)。有了大約 30 億個(gè)字符,您可以將人類 DNA 與大約 3,000 本厚厚的食譜進(jìn)行比較。每次細(xì)胞分裂時(shí),您的整個(gè) DNA 都必須被復(fù)制,而且在復(fù)制 3??,000 份食譜時(shí),可能會(huì)出現(xiàn)筆誤——一種可以將細(xì)胞轉(zhuǎn)化為癌細(xì)胞的突變,這并非不可想象。

幸運(yùn)的是,我們體內(nèi)的大多數(shù)細(xì)胞都有兩套食譜,一套來自我們的母親,一套來自我們的父親。這意味著所有食譜仍然可以輕松閱讀,即使其中一個(gè)出現(xiàn)錯(cuò)誤。從統(tǒng)計(jì)學(xué)上講,每次分裂時(shí),您的細(xì)胞在兩本食譜中完全相同的字符上出錯(cuò)的可能性非常小。舉個(gè)例子,繼續(xù)食譜的類比:番茄醬中的“球”首先變成媽媽食譜中番茄醬中的“公牛”,然后是父親版本的“鈴鐺”,反之亦然。

因?yàn)槟愕?DNA 中字母以這種方式扭曲的可能性非常小,基因研究假設(shè)這種情況根本不會(huì)發(fā)生,因此我們 DNA 中的字母只改變一次。KU Leuven 和倫敦弗朗西斯·克里克研究所的一項(xiàng)大規(guī)模研究現(xiàn)在表明,這種假設(shè)——至少對(duì)于癌細(xì)胞而言——是不正確的。

雙突變絕非偶然

該團(tuán)隊(duì)檢查了來自 38 種不同類型腫瘤的 2,658 個(gè)完整 DNA 序列,并在多達(dá) 21% 的病例中發(fā)現(xiàn)了這些雙突變。“盡管同一個(gè)字母在母本和父本拷貝中發(fā)生突變的可能性在統(tǒng)計(jì)學(xué)上非常小,但它確實(shí)發(fā)生在所研究的五分之一的腫瘤中。這個(gè)數(shù)字太大了,不可能是巧合,”博士后研究員 Jonas Demeulemeester 說。“我們可以看到,例如,在皮膚癌中,某些 DNA 片段對(duì)紫外線的損傷比其他片段更敏感,這解釋了一些雙重打擊,而對(duì)細(xì)胞沒有重大影響。這些信息對(duì)于尋找突變至關(guān)重要有助于癌細(xì)胞的形成,因此可以成為治療的良好靶點(diǎn),”

Demeulemeester 的團(tuán)隊(duì)正在努力開發(fā)新的計(jì)算機(jī)算法,以便其他科學(xué)家也可以檢測(cè)和研究這些雙突變。“到目前為止,這些雙重突變被忽視或被認(rèn)為是‘技術(shù)錯(cuò)誤’。這就是為什么它們沒有被包括在癌癥的遺傳分析中的原因。我們的研究表明它們確實(shí)很重要,并且需要能夠檢測(cè)它們并將它們的發(fā)生考慮在內(nèi)的方法,“Demeulemeester總結(jié)道。

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