蛋白質(zhì)組學(xué)是對(duì)蛋白質(zhì)的研究和分析，包括它們?cè)谏锵到y(tǒng)中的結(jié)構(gòu)、功能、相互作用和修飾。人類有大約 20,000 個(gè)基因，這些基因產(chǎn)生超過(guò)一百萬(wàn)種不同的蛋白質(zhì)變體，包括估計(jì)的 100,000 種蛋白質(zhì)同種型。這些蛋白質(zhì)變體構(gòu)成了蛋白質(zhì)組的巨大復(fù)雜性，而這些蛋白質(zhì)組在很大程度上仍未被探索。
越來(lái)越多的文獻(xiàn)表明蛋白質(zhì)異構(gòu)體具有很高的生物醫(yī)學(xué)重要性，因?yàn)閬?lái)自同一基因的蛋白質(zhì)異構(gòu)體可以具有不同的生物學(xué)功能，并在細(xì)胞過(guò)程中發(fā)揮不同的作用。在整個(gè)人群的蛋白質(zhì)變異水平上對(duì)蛋白質(zhì)組的研究可以讓我們了解生物學(xué)，并為我們?nèi)绾巫R(shí)別和治療疾病以及管理健康提供未來(lái)的科學(xué)進(jìn)步。
在 3 月 29 日發(fā)表在PLoS One雜志上的一項(xiàng)研究中，Seer 科學(xué)家與紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心的醫(yī)學(xué)博士 Luis Diaz 合作，發(fā)現(xiàn)了四種結(jié)構(gòu)不同的蛋白質(zhì)亞型，它們?cè)诜切〖?xì)胞肺癌(NSCLC) 患者中差異表達(dá)。通過(guò)使用深度、無(wú)偏見(jiàn)的蛋白質(zhì)組學(xué)方法在肽水平分辨率下比較癌癥患者與健康受試者的蛋白質(zhì)組學(xué)特征，可以鑒定在 NSCLC 中差異表達(dá)的蛋白質(zhì)亞型。
“這些發(fā)現(xiàn)表明，不同的蛋白質(zhì)亞型可能對(duì)不同的生物學(xué)機(jī)制和癌癥的發(fā)病機(jī)制有不同的貢獻(xiàn)，可能為識(shí)別新的診斷標(biāo)志物或新的治療靶點(diǎn)鋪平道路，”實(shí)體腫瘤腫瘤學(xué)部主任 Diaz 博士說(shuō)。在紀(jì)念斯隆凱特琳癌癥中心。“這里特別令人鼓舞的是，這些蛋白質(zhì)亞型是在血漿中檢測(cè)到的，血漿是一種易于獲取的樣本類型，能夠通過(guò)對(duì)患者進(jìn)行液體活檢評(píng)估來(lái)檢測(cè)和監(jiān)測(cè)癌癥。”
該研究分析了來(lái)自 NSCLC 患者和健康對(duì)照者的 188 種血漿蛋白質(zhì)組，以確定與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)亞型。這些蛋白質(zhì)變體在身體的生物通路中發(fā)揮著不同的作用，并且可以影響疾病的易感性和進(jìn)展。Seer 的深度、公正的蛋白質(zhì)組學(xué)平臺(tái)揭示了多種蛋白質(zhì)同種型，其中一些與健康對(duì)照相比在 NSCLC 中表現(xiàn)出顯著不同的行為，包括骨形態(tài)發(fā)生蛋白 1 (BMP1)、補(bǔ)體成分 4a (C4a)、補(bǔ)體成分 1r (C1r) 和乳酸脫氫酶 B (LDHB)。
BMP1 蛋白的一種關(guān)鍵亞型以前從未與 NSCLC 相關(guān)聯(lián)。研究人員發(fā)現(xiàn)，健康人的標(biāo)準(zhǔn)長(zhǎng)蛋白水平較高，而 NSCLC 患者的縮短蛋白亞型水平較高，這種蛋白缺乏釋放膠原蛋白的能力，這可能會(huì)影響腫瘤微環(huán)境。研究結(jié)果表明 BMP1 可能在 NSCLC 疾病的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮作用。
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