在美國和世界范圍內(nèi),肺癌仍然是癌癥相關(guān)死亡的主要原因。肺腺癌 (LUAD) 亞型患者已從新靶向藥物的開發(fā)中受益,但為另一種稱為肺鱗狀細(xì)胞癌 (LSCC) 的亞型尋找有效的新療法卻在很大程度上失敗了。
為了更多地了解 LSCC 的生物學(xué)基礎(chǔ),由麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)博德研究所和美國國家癌癥研究所臨床蛋白質(zhì)組學(xué)腫瘤分析聯(lián)盟 (CPTAC) 的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì),包括貝勒醫(yī)學(xué)院的合作者,開發(fā)了最大的和迄今為止最全面的 LSCC 分子圖譜。他們的努力,在Cell 中描述,將蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和基因組數(shù)據(jù)整合到 LSCC 的詳細(xì)“蛋白質(zhì)基因組學(xué)”視圖中。對這些數(shù)據(jù)的分析揭示了潛在的新藥物靶點(diǎn)、可能有助于癌癥逃避免疫療法的免疫調(diào)節(jié)途徑,甚至是一種新的 LSCC 分子亞型。該研究的數(shù)據(jù)可在 CPTAC 門戶網(wǎng)站上獲得。
“肺鱗狀細(xì)胞癌患者的治療選擇非常有限,即使在了解這種疾病方面取得了一定的成功,也可能會改變?nèi)藗兊纳睿?rdquo;博德研究所蛋白質(zhì)組學(xué)團(tuán)隊(duì)的組長 Shankha Satpathy 說。 -Cell研究的通訊作者,共同第一作者是 Broad 的 Karsten Krug 和 Pierre Jean Beltran,以及 Baylor 的 Sara Savage。“我們希望研究界,從基礎(chǔ)科學(xué)家到執(zhí)業(yè)腫瘤學(xué)家,將利用這一新資源來檢驗(yàn)假設(shè),刺激進(jìn)一步研究,并為臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)開辟新的數(shù)據(jù)驅(qū)動途徑,從長遠(yuǎn)來看,這可以使患者受益.”
有針對性的機(jī)會
在他們的研究中,該團(tuán)隊(duì)在治療前分析了 108 個腫瘤的 DNA、RNA、蛋白質(zhì)和翻譯后蛋白質(zhì)修飾(PTM,即磷酸化、乙?;头核鼗?,并將它們與正常組織進(jìn)行了比較。在他們看到開發(fā)新 LSCC 治療方法的機(jī)會中,研究人員將基因NSD3確定為攜帶額外FGFR1拷貝的腫瘤的可能靶點(diǎn),F(xiàn)GFR1是另一種經(jīng)常在 LSCC 中復(fù)制或擴(kuò)增的基因。之前的努力嘗試直接針對FGFR1,但未成功。該團(tuán)隊(duì)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究結(jié)果表明,NSD3可能是這些腫瘤中腫瘤生長和存活的關(guān)鍵驅(qū)動因素,使其成為潛在的治療靶點(diǎn)。
標(biāo)簽: 肺鱗狀細(xì)胞癌分子圖
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