在由德國(guó)萊布尼茨動(dòng)物園和野生動(dòng)物研究所 (Leibniz-IZW) 領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)新科學(xué)研究中，評(píng)估了來自非洲和蒙古水坑的水以及來自東南亞水蛭的血粉的能力，以便在無需尋找哺乳動(dòng)物病毒的情況下檢索哺乳動(dòng)物病毒。并捕捉哺乳動(dòng)物。科學(xué)家們使用高通量測(cè)序分析了樣本，以識(shí)別已知病毒以及科學(xué)上的新病毒。這兩種方法都被證明是流行病預(yù)防研究的合適工具，因?yàn)樗鼈兛梢园l(fā)現(xiàn)和監(jiān)測(cè)野生動(dòng)物病毒的宿主。例如，鑒定出一種最有可能與東南亞鹿種相關(guān)的新型。結(jié)果發(fā)表在科學(xué)期刊《生態(tài)學(xué)與進(jìn)化方法》上。
尋找和監(jiān)測(cè) SARS-CoV-2 等野生動(dòng)物病毒的宿主(尚未發(fā)現(xiàn)該病毒的宿主)具有挑戰(zhàn)性。許多野生動(dòng)物棲息的地區(qū)很難進(jìn)入，而且這些物種也很難找到或捕捉到。為了防止未來的大流行，如 ，迫切需要新的有效方法來發(fā)現(xiàn)和監(jiān)測(cè)在野生動(dòng)物中傳播的病毒。當(dāng)與高通量測(cè)序相結(jié)合時(shí)，基于環(huán)境 DNA (eDNA) 和無脊椎動(dòng)物衍生 DNA (iDNA) 的方法可能會(huì)增強(qiáng)可用的工具包來克服這些挑戰(zhàn)?？茖W(xué)家小組評(píng)估了來自非洲和蒙古水坑的水以及來自東南亞水蛭的血粉，以評(píng)估從兩種樣本類型中提取病毒的能力。此類樣本的通常限制是它們僅包含少量的低質(zhì)量 DNA，尤其是病原體 DNA。因此，作者使用現(xiàn)代“雜交捕獲”方法找出與目前已知的脊椎動(dòng)物病毒相似的序列，然后使用復(fù)雜的高通量技術(shù)對(duì)它們進(jìn)行測(cè)序。這種方法是成功的，因?yàn)樗试S在水和水蛭樣本中識(shí)別已知和新型病毒。
來自水樣的 DNA 產(chǎn)生了幾種斑馬和野驢常見的病毒，這是預(yù)料之中的，因?yàn)檫@些動(dòng)物經(jīng)常大量訪問水坑。以在非洲水坑中發(fā)現(xiàn)的病毒為例，作者在相關(guān)出版物中證明這些病毒仍然具有傳染性，這表明水本身可能是病毒傳播的來源。從東南亞水蛭中，鑒定出許多已知和新型病毒。特別令人感興趣的是一種以前科學(xué)上未知的新型，它可能代表科的一個(gè)全新屬，似乎與鹿種有關(guān)。
“對(duì)于埃博拉等許多最致命的病毒，我們?nèi)匀徊恢浪鼈儊碜阅睦铮?rdquo;野生動(dòng)物疾病系主任亞歷克斯格林伍德教授說。“當(dāng)前的大流行表明我們對(duì)自然界中的病毒多樣性仍然知之甚少。新方法可能會(huì)幫助我們識(shí)別新病毒及其潛在宿主，而不會(huì)遇到與直接收集野生動(dòng)物樣本相關(guān)的常見后勤和道德問題。”環(huán)境 DNA 在許多情況下被證明是有用的，包括難以進(jìn)入地區(qū)的野生動(dòng)物物種多樣性的表征、古代種群的研究以及最近的病原體研究。來自水的環(huán)境 DNA 和來自吸血無脊椎動(dòng)物的 DNA 可用于不同的環(huán)境。”
標(biāo)簽： DNA測(cè)序
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