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研究人員使用光穩(wěn)定劑來獲取原本隱藏的DNA構(gòu)象動力學(xué)化學(xué)細(xì)節(jié)

導(dǎo)讀 大阪-熒光光譜在生物醫(yī)學(xué)診斷中必不可少。人們可以認(rèn)為打開熒光燈就像在黑暗的房間里打開手電筒一樣??梢栽O(shè)計診斷測定法以用熒光探針標(biāo)記

大阪-熒光光譜在生物醫(yī)學(xué)診斷中必不可少。人們可以認(rèn)為打開熒光燈就像在黑暗的房間里打開手電筒一樣??梢栽O(shè)計診斷測定法以用熒光探針標(biāo)記例如DNA的特定分子。如果存在該特定分子的DNA,則會看到熒光或熒光發(fā)生變化。

有時,否則熒光分子會在短時間內(nèi)停止發(fā)光。這被稱為熒光閃爍,這使得很難以疾病診斷所需的超低濃度檢測生物分子。同時減少用于診斷的眨眼并從眨眼中提取有用的生化信息以進(jìn)行基礎(chǔ)研究的方法將是兩全其美的。

在最近在Angewandte Chemie上發(fā)表的一項研究中,大阪大學(xué)的研究人員使用了一種縮寫為COT(光穩(wěn)定劑)的著名分子來調(diào)節(jié)生化分析中的熒光閃爍。研究人員使用COT探測DNA分子的結(jié)構(gòu),并檢測超低濃度的癌癥RNA生物標(biāo)志物。

“ COT通過與熒光團(tuán)物理接觸來抑制熒光閃爍,從而增加熒光,”主要作者徐潔解釋說。“相反,通過被稱為熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)的廣泛使用的技術(shù)來調(diào)制發(fā)射,只能在更長的距離上(在1到10納米范圍內(nèi))起作用,并且只能在納秒級的時間范圍內(nèi)工作。”

研究人員首先在包含內(nèi)部間隔子的雙鏈DNA上測試了其設(shè)置。當(dāng)COT位于間隔基的一端而熒光團(tuán)位于另一端時,與不存在COT時相比,熒光更多。但是,熒光閃爍并沒有完全消除。研究人員通過測試墊片的化學(xué)結(jié)構(gòu)如何調(diào)節(jié)眨眼來利用這一事實。

“增加間隔基長度并增加pi堆積相互作用-間隔基中芳香環(huán)之間的非共價相互作用-會增加熒光團(tuán)在'off'狀態(tài)下的時間,”高級作者Kiyohiko Kawai說。“ FRET無法提供有關(guān)這些亞納米距離內(nèi)生物分子動力學(xué)的信息。”

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