肺炎是由細菌、病毒或真菌引起的肺泡感染。它是全世界發(fā)病和死亡的主要原因之一，造成臨床和經濟負擔以及全球公共衛(wèi)生問題。人類呼吸道的微生物生態(tài)系統(或微生物組)占據不同的生態(tài)位。科學家對呼吸道微生物組很感興趣，因為它通過刺激免疫系統和防止病原體感染來促進人類健康。巴斯德研究所和法國國家科學研究中心的科學家證明，微生物組組成、病原體負荷和臨床干預措施會影響嗜肺軍團菌引起的細菌性肺炎的嚴重程度。研究結果發(fā)表在《細胞報告醫(yī)學》雜志上2023 年 8 月 25 日。
在這項研究中，巴斯德研究所 Carmen Buchrieser 領導的細胞內細菌生物學單位的科學家與里昂軍團菌國家參考中心主任 Sophie Jarraud 合作，分析了呼吸道微生物群的多樣性和組成。細胞內細菌病原體嗜肺軍團菌引起的肺炎患者在整個住院期間都應避免感染細菌、古細菌、真菌和原生動物。嗜肺軍團菌導致一種被稱為退伍軍人病的嚴重肺炎，這種肺炎可以通過吸入淋浴、熱水浴缸或空調系統等人工水源中受污染的氣溶膠而感染。軍團病的死亡率從 5% 到 40% 不等，具體取決于臨床情況和地區(qū)。危險因素包括年老、已有肺部疾病、吸煙和免疫抑制，大約三分之二的報告病例發(fā)生在男性。歐盟軍團病確診病例從2005年的4,693例增加到2021年的10,004例，增長了113%。這種急劇上升的原因之一可能是氣候變化，
科學家團隊將高通量細菌、古菌和真菌標記基因測序與定量方法相結合，以描述患者在感染過程中以及醫(yī)院相關干預措施(例如機械通氣和呼吸機等)中呼吸道微生物群的發(fā)展情況?？股氐墓芾?。由 38 名嗜肺軍團菌引起的肺炎住院患者組成的獨特隊列被分析了。該研究的主要作者、巴斯德研究所細胞內細菌生物學部門負責人 Carmen Buchrieser 解釋道：“我們發(fā)現了復雜的微生物組動態(tài)，其中共生微生物和病原微生物共存，它們豐度之間的平衡會驅動微生物組恢復或生態(tài)失調。”科學家們觀察到，在住院初期，微生物組多樣性下降，病原體嗜肺軍團菌被抗生素治療殺死。但這一空缺很快就被其他機會性物種占據，這些物種通常對抗菌藥物具有抗藥性——這是繼發(fā)感染預防策略中應考慮的因素。細菌和真菌負荷最高的呼吸道微生物組也表現出較低的多樣性和病原體富集度，表明高生物量可能是繼發(fā)和/或合并感染的生物標志物。最后，科學家們表明軍團菌生物量與疾病嚴重程度和合并癥相關，這表明病原體定量應納入患者監(jiān)測中。機械通氣或施用某些類型的抗生素等臨床干預措施會影響微生物組的組成，從而影響疾病的結果。
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