Scripps Research 的科學(xué)家開發(fā)了一種新工具，可以使數(shù)據(jù)集、科學(xué)資源和培訓(xùn)材料更易于在線發(fā)現(xiàn)，從而幫助更快、更有效地促進(jìn)科學(xué)發(fā)現(xiàn)。
2023 年 4 月 20 日在BMC Bioinformatics上發(fā)表的一篇論文中描述了這種稱為數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)引擎 (DDE) Schema Playground 的新工具。DDESchema Playground 是一種基于瀏覽器的資源，使科學(xué)家能夠使他們的數(shù)據(jù)更容易找到并且可以在網(wǎng)絡(luò)上訪問，這在過去一直是一個(gè)重大障礙。
該資源是 Data Discovery Engine 不可或缺的一部分，Data Discovery Engine 是一個(gè)用戶友好的網(wǎng)站，可幫助提供商更有效地將其科學(xué)數(shù)據(jù)集與潛在目標(biāo)用戶聯(lián)系起來。研究人員可以使用 Schema Playground 以更具互操作性的方式構(gòu)建有關(guān)其數(shù)據(jù)集的信息，門戶成員還可以注冊(cè)他們的數(shù)據(jù)集，使數(shù)據(jù)集更易于發(fā)現(xiàn)和重用。
“一般來說，在網(wǎng)上有效地搜索和尋找東西是很困難的，尤其是在研究資產(chǎn)的復(fù)雜性水平上，”資深作者、斯克里普斯研究所綜合結(jié)構(gòu)與計(jì)算生物學(xué)系副教授 Chunlei Wu 博士說。“結(jié)構(gòu)良好的元數(shù)據(jù)，通常在搜索引擎的幕后，是成功在線發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵。DDE 提供了一套幕后元數(shù)據(jù)工具，如模式游樂場(chǎng)，以在生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)提供者和研究人員之間架起橋梁，因?yàn)閿?shù)據(jù)消費(fèi)者。”
作者之一、Scripps Research 的科學(xué)家 Ginger Tsueng 將 DDE 的效用比作使菜譜可以在網(wǎng)上找到。您的搜索結(jié)果可以根據(jù)評(píng)分、準(zhǔn)備時(shí)間、配料等有用的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行細(xì)分。這些具體、準(zhǔn)確的搜索結(jié)果是可能的，因?yàn)槊總€(gè)在線條目中都包含元數(shù)據(jù)(關(guān)于數(shù)據(jù)本身的描述符)。
但是，雖然食譜等信息的元數(shù)據(jù)已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化，因此更容易找到，但生物數(shù)據(jù)集的情況并非如此，主要是因?yàn)樗鼈兊膹?fù)雜性。例如，傳染病臨床前研究的數(shù)據(jù)集可能與免疫學(xué)臨床試驗(yàn)的數(shù)據(jù)集有很大不同。此外，每個(gè)研究分支都有自己獨(dú)特的元數(shù)據(jù)類型，因此很難在其中進(jìn)行搜索。
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