多樣性是好的,尤其是在抗體方面。眾所周知,一種被稱為V(D)J重組的基因組裝過程使我們的免疫系統(tǒng)能夠混合和匹配遺傳密碼,并產(chǎn)生新的抗體來克服新的威脅。但是這些基因片段是如何結(jié)合在一起的還是一個謎?!蹲匀弧冯s志的一項新研究提供了答案。
我們的脫氧核糖核酸鏈和一些蛋白質(zhì)一起被組織成一個叫做染色質(zhì)的包,它包含多個環(huán)。當(dāng)一個細胞需要構(gòu)建一種特定的蛋白質(zhì)時,染色質(zhì)環(huán)會帶來兩個相對較遠的DNA片段,這樣它們就可以一起工作。這些環(huán)中的許多都固定在適當(dāng)?shù)奈恢?,但是細胞有時可以在需要時重新排列環(huán)或產(chǎn)生新的環(huán)——尤其是癌細胞和免疫細胞。
這項由波士頓兒童醫(yī)院細胞和分子醫(yī)學(xué)項目(PCMM)主任弗雷德里克阿爾特博士領(lǐng)導(dǎo)的新研究詳細展示了我們的免疫系統(tǒng)B細胞是如何利用環(huán)形成過程制造新型抗體的。
掃描周期形成
研究人員表明,一對名為RAG1和RAG2的酶與染色質(zhì)環(huán)相關(guān)機制結(jié)合,啟動了V(D)J重組的第一步——連接D和J片段。RAG 1/2復(fù)合物首先與抗體基因的位點結(jié)合,稱為“重組中心”。當(dāng)DNA在循環(huán)形成過程中翻轉(zhuǎn)(“擠出”)時,RAG復(fù)合體掃描細胞想要結(jié)合的D和J部分。其他因素阻礙了擠壓過程,滾動的DNA懸浮在重組中心,這樣RAG就可以訪問所需的片段。
Alt說:“通過抗體基因位點的環(huán)擠壓過程,將合適的底物基因片段呈現(xiàn)給RAG復(fù)合體進行V(D)J重組。
雖然許多硬連線染色質(zhì)環(huán)是由一種叫做CTCF的因子形成和錨定的,但Alt實驗室表明,其他因素涉及動態(tài)情況,例如抗體形成,這需要動態(tài)的新環(huán)。該研究還證實了一種名為cohesin的蛋白質(zhì)在驅(qū)動環(huán)擠壓/RAG掃描過程中的作用。
“雖然這些發(fā)現(xiàn)是在抗體形成中V(D)J重組的背景下做出的,但它們對可能更廣泛參與基因調(diào)控的過程產(chǎn)生了影響,”Alt說。
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