喬治亞州奧古斯塔(2021 年 11 月 23 日)——一個(gè)新的“圖像分析管道”讓科學(xué)家們快速了解疾病或損傷如何改變身體,直至單個(gè)細(xì)胞。
它被稱為 TDAExplore,它采用顯微鏡提供的詳細(xì)成像,將其與稱為拓?fù)鋵W(xué)的數(shù)學(xué)熱門領(lǐng)域配對(duì),它提供了關(guān)于事物如何排列的洞察力,以及人工智能的分析能力,例如,提供了一個(gè)新的視角說,改變從ALS和在那里他們發(fā)生的細(xì)胞產(chǎn)生的細(xì)胞埃里克博士礬,細(xì)胞生物學(xué)家和神經(jīng)學(xué)家在喬治亞醫(yī)學(xué)院。
他們?cè)趫?bào)告中報(bào)告說,這是使用個(gè)人計(jì)算機(jī)從顯微圖像中生成定量的、可測(cè)量的、因此客觀的信息的“可訪問的、強(qiáng)大的選擇”,這些信息可能也適用于其他標(biāo)準(zhǔn)成像技術(shù),如 X 射線和 PET 掃描。雜志模式。
“我們認(rèn)為這是使用計(jì)算機(jī)為我們提供有關(guān)圖像集彼此不同的新信息的令人興奮的進(jìn)步,”Vitriol 說。“正在發(fā)生的實(shí)際生物學(xué)變化是什么,包括那些我可能看不到的變化,因?yàn)樗鼈兲⑿×?,或者因?yàn)槲覍?duì)我應(yīng)該看的地方有某種偏見。”
這位神經(jīng)科學(xué)家表示,至少在分析數(shù)據(jù)部門,計(jì)算機(jī)比我們的大腦更勝一籌,不僅體現(xiàn)在其客觀性方面,還體現(xiàn)在它們可以評(píng)估的數(shù)據(jù)量方面。計(jì)算機(jī)視覺使計(jì)算機(jī)能夠從數(shù)字圖像中提取信息,是一種已經(jīng)存在了數(shù)十年的機(jī)器學(xué)習(xí)類型,因此他和他的同事兼通訊作者、佛羅里達(dá)大學(xué)數(shù)學(xué)家、專家彼得·布貝尼克博士 (Dr. Peter Bubenik)在拓?fù)鋽?shù)據(jù)分析方面,決定將顯微鏡的細(xì)節(jié)與拓?fù)淇茖W(xué)和人工智能的分析能力合作。Vitriol 說,拓?fù)浜?Bubenik 是關(guān)鍵。
拓?fù)鋵?duì)于圖像分析來說是“完美的”,因?yàn)閳D像由排列在空間中的物體的圖案組成,他說,拓?fù)鋽?shù)據(jù)分析(TDAExplore 中的 TDA)幫助計(jì)算機(jī)也識(shí)別土地的位置,在這種情況下,肌動(dòng)蛋白 -一種蛋白質(zhì)和纖維或細(xì)絲的基本組成部分,有助于賦予細(xì)胞形狀和運(yùn)動(dòng)——已經(jīng)移動(dòng)或改變了密度。這是一個(gè)高效的系統(tǒng),它可以學(xué)習(xí) 20 到 25 張圖像,而不是用數(shù)百張圖像來訓(xùn)練計(jì)算機(jī)如何識(shí)別和分類它們。
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