西奈山的研究人員使用來自近30,000人的遺傳數(shù)據(jù)來建立代表不同祖先群體的數(shù)據(jù)集的風(fēng)險(xiǎn)評分,這提高了對炎癥性腸病(IBD)風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測,包括克羅恩病和潰瘍性結(jié)腸炎。這項(xiàng)研究發(fā)表在12月24日的《胃腸病學(xué)雜志》上。
研究人員發(fā)現(xiàn),利用來自西奈山的BioMe生物庫中多個(gè)人群的關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)建立的多基因風(fēng)險(xiǎn)評分,可以最大化生物庫中每個(gè)人群的IBD預(yù)測。BioMe是西奈山的一項(xiàng)系統(tǒng)工作,它正在根據(jù)患者的分子特征完全改變疾病的診斷和分類。研究表明,通過整合數(shù)據(jù)計(jì)算出的風(fēng)險(xiǎn)評分顯著提高了對歐洲猶太和西班牙血統(tǒng)的個(gè)人、英國生物銀行中的Naz、Askin和歐洲個(gè)人的預(yù)測,這些人包括50萬歲之間的生物和醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù),在40至69歲時(shí)生活在英國。非洲裔患者的預(yù)測能力較低,
該研究的資深作者、醫(yī)學(xué)博士Judy H. Cho說:“因?yàn)樵缙诟深A(yù)措施甚至預(yù)防措施正在考慮和制定中,準(zhǔn)確預(yù)測整個(gè)祖先個(gè)體遺傳疾病風(fēng)險(xiǎn)的能力是可能對患者預(yù)后產(chǎn)生積極影響的關(guān)鍵途徑?!蔽髂紊揭量册t(yī)學(xué)院轉(zhuǎn)化遺傳學(xué)系主任,查爾斯布朗夫曼個(gè)性化醫(yī)學(xué)研究所所長?!斑@些發(fā)現(xiàn)支持需要更大的遺傳多樣性,包括更多關(guān)于非裔美國人的數(shù)據(jù),以加強(qiáng)疾病風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測,減少所有人群之間的健康差異?!?
這些多基因風(fēng)險(xiǎn)評分——代表基于個(gè)體許多常見遺傳變異總和的總體風(fēng)險(xiǎn)評估——是使用來自阿斯金的歐洲人、非裔美國人和納粹猶太人隊(duì)列的IBD關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)計(jì)算的。此外,研究人員評估了每個(gè)人群中發(fā)病非常早的IBD相關(guān)基因的罕見突變,發(fā)現(xiàn)在LRBA突變的非裔美國人攜帶者中,LRBA和CTLA-4蛋白的表達(dá)降低。LRBA缺乏癥將增加對IBD的易感性,并降低CTLA-4的表達(dá),這可以通過氯喹逆轉(zhuǎn),氯喹是一種常用的抗瘧藥。Cho實(shí)驗(yàn)室的未來研究將集中在預(yù)測哪些患者亞群可能從靶向該途徑中受益。
這項(xiàng)研究的第一作者,伊坎大學(xué)遺傳與基因組科學(xué)系博士后凱爾格特勒博士說:“由于LRBA和CTLA-4的表達(dá)下降會(huì)導(dǎo)致IBD,氯喹可以部分恢復(fù)表達(dá)是令人鼓舞的?!蔽髂紊结t(yī)學(xué)院。
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