免疫療法,例如免疫檢查點抑制劑,已經(jīng)改變了晚期癌癥的治療。與殺死癌細胞的化學療法不同,這些藥物可幫助人體的免疫系統(tǒng)自行發(fā)現(xiàn)并摧毀癌細胞。不幸的是,只有一部分患者對免疫檢查點抑制劑有長期反應(yīng)——而這些治療方法的成本很高,而且有副作用。
研究人員開發(fā)了一種兩步方法,使用全外顯子組測序?qū)㈩A(yù)測癌癥患者是否會對免疫療法產(chǎn)生反應(yīng)的基因和途徑歸零。該研究發(fā)表在《自然通訊》雜志上,由紐約大學、威爾康奈爾醫(yī)學中心和紐約基因組中心的研究人員進行,闡明了使用全外顯子組測序如何比目前的實驗室測試更好地預(yù)測治療反應(yīng)。
“我們能更好地預(yù)測誰將從免疫療法中受益嗎?科學家們已經(jīng)開發(fā)出各種生物標志物來幫助預(yù)測免疫療法的治療反應(yīng),但仍然需要一個強大的、臨床實用的預(yù)測模型,”紐約大學生物學助理教授 Neville Sanjana 說,紐約大學格羅斯曼醫(yī)學院神經(jīng)科學和生理學助理教授,紐約基因組中心核心教員,該研究的共同資深作者。
已知一些生物標志物——包括年齡、腫瘤類型和癌細胞中發(fā)現(xiàn)的突變數(shù)量(稱為腫瘤突變負荷)與對免疫療法的反應(yīng)相關(guān)。通過分析數(shù)百個基因計算出的腫瘤突變負擔是最完善的預(yù)測因子,通常用于確定患者是否有資格使用免疫檢查點抑制劑。
如果科學家研究我們基因的更大部分,這是否有助于更好地預(yù)測哪些患者會對免疫療法產(chǎn)生反應(yīng)?全外顯子組測序是一種對編碼蛋白質(zhì)的基因組部分進行測序的方法——大約 20,000 個基因,或基因組的 2%——以尋找可能與疾病有關(guān)的突變。
雖然全外顯子組測序并未廣泛用于癌癥治療,但最近的一些免疫療法研究已開始包括測序。這些研究規(guī)模雖小,但共同有助于闡明基因組因素與患者對免疫療法的反應(yīng)之間的關(guān)系。
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