在一項(xiàng)首創(chuàng)的實(shí)驗(yàn)中，研究人員確定了 127 個(gè)基因與免疫疾病之間的聯(lián)系，為 T 細(xì)胞激活過程中基因活動(dòng)的序列和時(shí)間提供了新的見解，這是調(diào)節(jié)身體免疫反應(yīng)的關(guān)鍵過程。
該研究由 Open Targets、威康桑格研究所和葛蘭素史克的研究人員領(lǐng)導(dǎo)，于今天(2022 年 5 月 26 日)在Nature Genetics上發(fā)表。這是一項(xiàng) 3 年研究努力的結(jié)果，它首次表明在 T 細(xì)胞激活的不同階段，許多與疾病相關(guān)的變體是活躍的，為指導(dǎo)開發(fā)針對(duì)類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等免疫疾病的新療法提供了關(guān)鍵信息，類型-1 糖尿病和克羅恩病。
T細(xì)胞是一組有助于管理人體免疫系統(tǒng)的白細(xì)胞。當(dāng) T 細(xì)胞發(fā)生故障時(shí)，它們會(huì)導(dǎo)致嚴(yán)重的免疫缺陷，使患者面臨感染的高風(fēng)險(xiǎn)，以及更常見的自身免疫性疾病，如 1 型糖尿病和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎，身體會(huì)對(duì)自身細(xì)胞發(fā)起攻擊。
T 細(xì)胞活化是免疫系統(tǒng)對(duì)感染作出反應(yīng)的第一步。在分子水平上繪制這個(gè)激活周期對(duì)于了解它可能出錯(cuò)的地方以及在哪些點(diǎn)治療干預(yù)可以影響這個(gè)過程至關(guān)重要。但迄今為止，僅繪制了有限的激活序列快照，例如在單個(gè)時(shí)間點(diǎn)查看細(xì)胞。這些快照技術(shù)也無法捕獲每個(gè)階段存在的細(xì)胞亞型的多樣性。Open Targets 之前的研究表明，與免疫疾病相關(guān)的 DNA 的某些變異與 T 細(xì)胞的激活過程有關(guān)。
在這項(xiàng)新研究中，威康桑格研究所和葛蘭素史克的研究人員使用單細(xì)胞 RNA 測(cè)序技術(shù)對(duì)超過 650,000 個(gè)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了分析，以繪制 T 細(xì)胞激活過程中每個(gè)細(xì)胞亞型的基因活動(dòng)時(shí)間。他們確定了受 DNA 變化調(diào)控的基因，這些基因在 T 細(xì)胞激活期間從靜止?fàn)顟B(tài)到三個(gè)不同時(shí)間點(diǎn)在每個(gè)細(xì)胞中打開或關(guān)閉。
該團(tuán)隊(duì)確定了超過 6,400 個(gè)參與激活過程的基因。通過將他們的數(shù)據(jù)與 13 種免疫疾病的已知遺傳變異進(jìn)行比較，他們能夠找到與這些疾病相關(guān)的 127 個(gè)基因，其中一些僅在以前未研究過的特定時(shí)間點(diǎn)出現(xiàn)。
來自 Wellcome Sanger 研究所的該研究的第一作者 Blagoje Soskic 博士說：“通過分析 T 細(xì)胞激活過程中的多個(gè)時(shí)間點(diǎn)，我們的研究強(qiáng)調(diào)了基因調(diào)控可以針對(duì)特定的細(xì)胞狀態(tài)。至關(guān)重要的是，我們能夠?qū)?DNA 變異與特定基因(尤其是細(xì)胞類型)在激活過程中不同時(shí)間的活性變化聯(lián)系起來。這種前所未有的粒度是更好地了解 T 細(xì)胞激活的關(guān)鍵，為尋求新療法提供更深入的數(shù)據(jù)用于免疫疾病。”
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