使用人工智能，UT 西南大學(xué)的科學(xué)家們已經(jīng)確定了可能影響小鼠免疫系統(tǒng)的數(shù)千種基因突變。這項工作是一位諾貝爾獎獲得者尋求在哺乳動物中發(fā)現(xiàn)幾乎所有此類變異的一部分。
“這項研究確定101名新基因候選人大于被要求為豁免95%的機會，說：”布魯斯·博伊特勒，MD，該主任對宿主防御的遺傳學(xué)研究中心(CGHD)，并在本周發(fā)表的研究報告的通訊作者在的美國國家科學(xué)院的論文集。“我們已經(jīng)通過重新創(chuàng)建突變或敲除基因來驗證其中的許多候選者。”該軟件的主要作者、CGHD 的計算生物學(xué)家 Darui Xu 編寫了該軟件。
“我們開發(fā)了名為 Candidate Explorer (CE) 的軟件，該軟件使用機器學(xué)習(xí)算法來識別可能導(dǎo)致與免疫相關(guān)的特征的化學(xué)誘導(dǎo)突變。該軟件確定了我們誘導(dǎo)的任何突變在之后被驗證為致病突變的概率。進一步測試，” Beutler 說。他發(fā)現(xiàn)了一個重要的受體家族，使哺乳動物能夠快速感知感染并引發(fā)炎癥反應(yīng)，從而獲得了2011 年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎。
“CE 的目的是幫助研究人員預(yù)測與表型(性狀或功能)相關(guān)的突變是否是真正的致病突變。CE 已經(jīng)幫助我們鑒定了數(shù)百個在免疫方面具有新功能的基因。這將提高我們對免疫系統(tǒng)，這樣我們就可以找到保持其健壯的新方法，并了解它有時會出現(xiàn)問題的原因，”德州大學(xué)西南分校的攝政教授、免疫學(xué)和內(nèi)科教授 Beutler 說。
“CE 提供了一個分?jǐn)?shù)，告訴我們?nèi)绻覀冎匦庐a(chǎn)生突變或敲除基因，特定突變-表型關(guān)聯(lián)將被驗證因果關(guān)系的可能性，”他說。
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