Gaurav Gaiha, MD, DPhil 是 MGH、麻省理工學院和哈佛大學拉根研究所的成員，研究艾滋病毒，人類已知的變異最快的病毒之一。但 HIV 的變異能力在 RNA 病毒中并不是獨一無二的——隨著時間的推移，大多數(shù)病毒會發(fā)生突變，或改變其遺傳密碼。如果病毒是致病的，正確的突變可以通過改變免疫系統(tǒng)用來將病毒識別為威脅的病毒片段來使病毒逃避免疫反應(yīng)，科學家稱之為表位。
為了對抗 HIV 的高突變率，Gaiha 和 Elizabeth Rossin 醫(yī)學博士、馬薩諸塞州眼耳科視網(wǎng)膜研究員、Brigham 將軍的成員，開發(fā)了一種稱為基于結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)分析的方法。有了這個，他們可以識別受突變限制或限制的病毒片段。突變受限表位的變化很少見，因為它們會導(dǎo)致病毒失去感染和復(fù)制的能力，基本上使其無法自我繁殖。
大流行開始時，Gaiha 立即意識到將基于 HIV 結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)分析原理應(yīng)用于 SARS-CoV-2(導(dǎo)致 的病毒)的機會。他和他的團隊推斷，該病毒可能會發(fā)生變異，其方式可能會使其逃避自然免疫和疫苗誘導(dǎo)的免疫。使用這種方法，該團隊確定了突變受限的 SARS-CoV-2 表位，這些表位可以被稱為T 細胞的免疫細胞識別。然后，這些表位可用于疫苗以訓(xùn)練 T 細胞，提供保護性免疫。最近發(fā)表在Cell 上的這項工作強調(diào)了 T 細胞疫苗的可能性，該疫苗可以針對 SARS-CoV-2 和其他 SARS 樣的新出現(xiàn)和新興變體提供廣泛的保護。
從 大流行的最早階段開始，該團隊就知道必須為未來可能發(fā)生的突變做好準備。其他實驗室已經(jīng)公布了大約 40% SARS-CoV-2 病毒的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)(藍圖)，研究表明具有強大 T 細胞反應(yīng)，特別是 CD8+ T 細胞反應(yīng)的患者更有可能在 COVID- 19 感染。
Gaiha 的團隊知道這些見解可以與他們獨特的方法相結(jié)合：用于識別突變受限表位的網(wǎng)絡(luò)分析平臺和他們剛剛開發(fā)的一種檢測方法，該報告目前正在Cell Reports 上發(fā)表，以識別成功靶向的表位HIV 感染者的 CD8+ T 細胞。將這些進展應(yīng)用于 SARS-CoV-2 病毒，他們在 SARS-CoV-2 中確定了 311 個高度網(wǎng)絡(luò)化的表位，這些表位可能受到 CD8+ T 細胞的突變限制和識別。
標簽： T細胞
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