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新的網(wǎng)絡(luò)工具如何對抗抗菌性

導(dǎo)讀 1943 年,兩位名叫 Max Delbrück 和 Salvador Luria 的科學(xué)家進(jìn)行了一項(xiàng)實(shí)驗(yàn),證明細(xì)菌可以隨機(jī)突變,獨(dú)立于外部刺激,例如威

1943 年,兩位名叫 Max Delbrück 和 Salvador Luria 的科學(xué)家進(jìn)行了一項(xiàng)實(shí)驗(yàn),證明細(xì)菌可以隨機(jī)突變,獨(dú)立于外部刺激,例如威脅細(xì)菌細(xì)胞生存的抗生素。今天,Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)在實(shí)驗(yàn)室中被廣泛用于不同的目的——科學(xué)家們使用這個經(jīng)典實(shí)驗(yàn)來確定微生物突變率。在進(jìn)行 Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)時,科學(xué)家需要高效的計算機(jī)算法來從數(shù)據(jù)中提取可靠的突變率估計值,他們還需要精心設(shè)計的軟件工具來訪問這些復(fù)雜的算法。

多年來,開發(fā)了多種網(wǎng)絡(luò)工具,使研究人員能夠更輕松地在計算機(jī)上輸入和分析數(shù)據(jù),以提高 Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)的效率和功效。然而,沒有現(xiàn)有的網(wǎng)絡(luò)工具允許科學(xué)家訪問許多最近開發(fā)的算法,這些算法可以從數(shù)據(jù)中提取更準(zhǔn)確的微生物突變率估計值。

德州農(nóng)工大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授 Qi Zheng 博士最近開發(fā)了一種名為 webSalvador 的新網(wǎng)絡(luò)工具,以填補(bǔ)現(xiàn)有網(wǎng)絡(luò)工具留下的幾個空白。在微生物資源公告 (MRA)期刊中,Zheng 解釋了 WebSalvador 如何提供許多對細(xì)菌突變研究至關(guān)重要的理想功能,包括構(gòu)建置信區(qū)間的更準(zhǔn)確方法和比較突變率的新方法。

該網(wǎng)絡(luò)工具還消除了科學(xué)家學(xué)習(xí)編程和軟件語言的需要,鄭將其描述為使用 Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)解決突變研究中的重要問題的“重要障礙”,例如全球公共衛(wèi)生頭痛的細(xì)菌藥物抵抗性。

“對于大多數(shù)生物學(xué)家來說,學(xué)習(xí)軟件語言可能具有挑戰(zhàn)性且耗時,”鄭說。“借助 webSalvador,生物學(xué)家可以輕松輸入數(shù)據(jù)并查看結(jié)果。”

提高 Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)的效率和功效很重要,因?yàn)樗罱K可以幫助推進(jìn)突變研究,這對生命科學(xué)的許多分支都至關(guān)重要。鄭將細(xì)菌耐藥性作為 Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)最重要的應(yīng)用之一,并以耐多藥結(jié)核病為例,其中先進(jìn)的突變研究至關(guān)重要。他稱微生物耐藥性是一個“廣泛存在的全球健康問題”

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