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SARS-CoV-2基因組分析揭示了新的墨西哥變種

導(dǎo)讀 博洛尼亞大學(xué)藥學(xué)與生物技術(shù)系的一個(gè)研究小組分析了超過(guò)一百萬(wàn)個(gè) SARS-CoV-2 基因組序列。這種分析導(dǎo)致確定了一種新變種,該變種在過(guò)去幾

博洛尼亞大學(xué)藥學(xué)與生物技術(shù)系的一個(gè)研究小組分析了超過(guò)一百萬(wàn)個(gè) SARS-CoV-2 基因組序列。這種分析導(dǎo)致確定了一種新變種,該變種在過(guò)去幾周主要在墨西哥傳播,但也在歐洲發(fā)現(xiàn)。他們發(fā)表在《醫(yī)學(xué)病毒學(xué)雜志》上的論文提出了所謂的“墨西哥變種”,其學(xué)名是 T478K。與其他菌株一樣,這會(huì)導(dǎo)致Spike 蛋白發(fā)生突變,從而使能夠附著并穿透其靶細(xì)胞。

這種變體越來(lái)越多地在北美人群中傳播,尤其是在墨西哥。迄今為止,該變種覆蓋了該領(lǐng)域現(xiàn)有病毒的 50% 以上。傳播的速度和速度讓人想起“英國(guó)變體”。Spike 蛋白的突變?cè)诮Y(jié)構(gòu)上位于與人類受體 ACE2 相互作用的區(qū)域。附著在該受體上以感染細(xì)胞,從而以更有效的方式傳播感染”。

Federico Giorgi,博洛尼亞大學(xué)藥學(xué)與生物技術(shù)系研究協(xié)調(diào)員兼教授

研究人員從分析在國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)現(xiàn)的近 120 萬(wàn)份 SARS-CoV-2 基因組測(cè)序樣本開(kāi)始,直到 2021 年 4 月 27 日。在 11435 個(gè)樣本中檢測(cè)到了新的 T478K 變體。這是一個(gè)月前呈現(xiàn)相同變體的樣本數(shù)量的兩倍。自 2021 年初以來(lái)的這種增長(zhǎng)使研究人員感到震驚。“墨西哥變種”在男性和女性以及年齡范圍內(nèi)均勻分布。這種變異占墨西哥所有測(cè)序的 52.8%,而在美國(guó)它僅出現(xiàn)在 2.7% 的測(cè)序樣本中。至于歐洲,“墨西哥變種”在德國(guó)、瑞典和瑞士的傳播很弱。在幾乎不存在,只有 4 例報(bào)告病例。

表征該變體的突變位于負(fù)責(zé)與人類受體 ACE2 相互作用的 Spike 蛋白區(qū)域:這是允許進(jìn)入細(xì)胞的機(jī)制。類似的突變對(duì)于過(guò)去幾個(gè)月引起關(guān)注的所有變體都很常見(jiàn)。事實(shí)上,最近的變種因其高感染率而引人注目,這使得它們?cè)谑澜缭S多地區(qū)普遍存在。

研究人員通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬測(cè)試了 T478K Spike 蛋白的作用,發(fā)現(xiàn)這種突變蛋白可以改變表面靜電荷。因此,它不僅可以改變與 ACE2 人蛋白的相互作用,還可以改變與免疫系統(tǒng)抗體的相互作用,從而阻礙藥物療效。

Giorgi 總結(jié)道:“由于國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)中有大量可用數(shù)據(jù),我們可以通過(guò)監(jiān)測(cè)變種在不同地理區(qū)域的傳播,幾乎實(shí)時(shí)控制局勢(shì)。”“在接下來(lái)的幾個(gè)月里繼續(xù)努力對(duì)于迅速采取有效手段至關(guān)重要”。

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