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研究人員發(fā)現(xiàn)刺激乳腺癌基因活性的超級(jí)增強(qiáng)劑

導(dǎo)讀 三陰性乳腺癌(TNBC)是一種具有高死亡率的侵略性乳腺癌。目前,化學(xué)療法是主要的治療選擇,但臨床效果仍不令人滿意。由城市大學(xué)(CityU)生物

三陰性乳腺癌(TNBC)是一種具有高死亡率的侵略性乳腺癌。目前,化學(xué)療法是主要的治療選擇,但臨床效果仍不令人滿意。由城市大學(xué)(CityU)生物學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的研究小組已經(jīng)鑒定并鑒定了一組特定的超級(jí)增強(qiáng)子,它們可以刺激相關(guān)的關(guān)鍵癌癥基因的活性。

研究還發(fā)現(xiàn),某些特定的超級(jí)增強(qiáng)子的缺失可以減少腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)。最新發(fā)現(xiàn)可能有助于為TNBC患者發(fā)現(xiàn)新的有效藥物靶標(biāo),以提高其生存機(jī)會(huì)。

傳統(tǒng)上,癌癥研究一直專注于鑒定不同類型乳腺癌中的基因突變。相比之下,表觀遺傳回路如何影響癌癥的特征仍然很差。

表觀遺傳學(xué)改變:誘發(fā)癌癥的另一種方法

基因突變是DNA序列一個(gè)或多個(gè)部分的變化,而表觀遺傳學(xué)的變化也會(huì)改變基因的DNA,但不會(huì)改變序列水平。取而代之的是,將特殊標(biāo)記(稱為表觀遺傳標(biāo)記)添加到DNA序列中或從中刪除,以改變蛋白質(zhì)在體內(nèi)的工作方式。超級(jí)增強(qiáng)劑中包含特定的表觀遺傳標(biāo)記。因此,超增強(qiáng)劑的放松調(diào)節(jié)(即異常調(diào)節(jié))可以誘導(dǎo)癌癥驅(qū)動(dòng)蛋白的大量產(chǎn)生并促進(jìn)癌癥的形成。

城大生物醫(yī)學(xué)系的癌癥生物學(xué)家麗貝卡·錢月明博士和計(jì)算生物學(xué)家王欣博士共同研究了這些超級(jí)增強(qiáng)劑如何影響TNBC細(xì)胞。 。他們的發(fā)現(xiàn)發(fā)表在科學(xué)雜志《自然通訊》上,標(biāo)題為“通過(guò)多組學(xué)分析在三陰性乳腺癌中定義超級(jí)增強(qiáng)劑”。

王博士的團(tuán)隊(duì)將21種細(xì)胞系的多級(jí)表觀基因組測(cè)序數(shù)據(jù)與4000多個(gè)患者樣品的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和臨床信息相結(jié)合,使用多基因組分析的方法進(jìn)行了深入的數(shù)據(jù)挖掘,并建立了特定的超級(jí)增強(qiáng)子靶標(biāo)調(diào)節(jié)劑適用于所有類型乳腺癌的網(wǎng)絡(luò)。

癌癥生長(zhǎng)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑

我們的綜合分析表明,超級(jí)增強(qiáng)劑的聚類足以表征乳腺癌的不同亞型。重要的是,基于調(diào)控網(wǎng)絡(luò),我們確定基因FOXC1是由TNBC特異的超級(jí)增強(qiáng)劑驅(qū)動(dòng)的癌癥生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵調(diào)控因子。FOXC1可以預(yù)測(cè)患者的生存,并有助于制定針對(duì)表觀遺傳回路的治療策略。”

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