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研究人員擴(kuò)大小型蠕蟲的基因組編輯

導(dǎo)讀 了解基因調(diào)控區(qū)域中特定突變的作用-開啟和關(guān)閉基因的DNA和RNA部分-對(duì)于揭示基因組的工作方式以及正常發(fā)育和疾病非常重要。但是,以系統(tǒng)的方

了解基因調(diào)控區(qū)域中特定突變的作用-開啟和關(guān)閉基因的DNA和RNA部分-對(duì)于揭示基因組的工作方式以及正常發(fā)育和疾病非常重要。但是,以系統(tǒng)的方式研究這些調(diào)控區(qū)域中的多種突變是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)。盡管細(xì)胞系和酵母菌取得了進(jìn)展,但對(duì)活體動(dòng)物的研究卻很少,尤其是在大型種群中。

亥姆霍茲協(xié)會(huì)(MDC)的馬克斯·德爾布呂克分子醫(yī)學(xué)中心的實(shí)驗(yàn)和計(jì)算生物學(xué)家聯(lián)手建立了一種方法,可以在多達(dá)一百萬(wàn)個(gè)細(xì)微蠕蟲中誘發(fā)數(shù)千種不同的突變,并分析由此對(duì)蠕蟲的物理特性產(chǎn)生的影響和功能。

博士Jonathan Froehlich表示:“對(duì)于細(xì)胞系,您缺少開發(fā)過(guò)程,許多細(xì)胞類型以及所有細(xì)胞類型之間的相互作用都影響基因調(diào)控。”柏林醫(yī)學(xué)系統(tǒng)生物學(xué)研究所(BIMSB)的MDC基因調(diào)控元件系統(tǒng)生物學(xué)系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室的候選人,也是第一篇論文的第一作者。“我們現(xiàn)在可以真正在重要的環(huán)境中測(cè)試這些調(diào)控序列,并觀察對(duì)生物體的影響。”

蠕蟲遇見CRISPR-Cas9

微小的秀麗隱桿線蟲蠕蟲是研究人類基因調(diào)控過(guò)程的絕佳代理。“我們和他們是如此相似,”弗羅里希說(shuō)。“它們有專門的組織,肌肉,神經(jīng),皮膚,腸道,生殖系統(tǒng)。對(duì)于基因調(diào)控研究,重要的是要擁有專門的細(xì)胞類型和發(fā)育。”

為了在大型秀麗隱桿線蟲種群中有效誘導(dǎo)各種突變,研究人員轉(zhuǎn)向了基因編輯工具CRISPR-Cas9。他們確定了最多10個(gè)被Cas9酶切割的DNA片段,而這些片段被RNA引導(dǎo)至這些斑點(diǎn)。但是研究人員沒(méi)有發(fā)出任何其他指示,而是讓生物體通過(guò)自然機(jī)制修復(fù)DNA斷裂。這導(dǎo)致以遺傳密碼的缺失或插入形式出現(xiàn)的多種突變,稱為“ indels”。

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