有可能只有2%的人類基因組能夠編碼所有能夠產(chǎn)生細(xì)胞功能的蛋白質(zhì)——從能量產(chǎn)生到組織修復(fù)。
另外98%呢?
這種所謂的非編碼DNA的很大一部分控制著基因的表達(dá),開啟和關(guān)閉基因。這條規(guī)則至關(guān)重要,因?yàn)槊總€(gè)細(xì)胞都有相同的DNA。
換句話說,使肌肉細(xì)胞不同于腦細(xì)胞的唯一因素是哪些基因被激活了。
這就是為什么密歇根大學(xué)的科學(xué)家正在使用復(fù)雜的計(jì)算方法來研究非編碼脫氧核糖核酸中的遺傳變異如何增加人們對(duì)某些疾病的易感性,例如糖尿病和癌癥。
在《遺傳學(xué)雜志》的一篇新文章中,他們比較了過去幾年中發(fā)現(xiàn)的五種類型的調(diào)節(jié)區(qū),以找出這些區(qū)域在不同類型細(xì)胞中的表現(xiàn)。
“當(dāng)人們?cè)噲D研究基因調(diào)控是如何發(fā)生的時(shí),他們將使用測(cè)序來研究不同的表觀基因組信息,并試圖理解分子譜,”第一作者Arushi Varshney博士說。人類遺傳學(xué)的候選人。
表觀基因組學(xué)是指由DNA序列以外的因素引起的基因組織的變化。
例如,研究人員最近發(fā)現(xiàn),與疾病相關(guān)的遺傳變異——我們獨(dú)特的DNA的輕微變異——往往位于基因組中作為基因調(diào)節(jié)元件的區(qū)域,稱為增強(qiáng)子和啟動(dòng)子。
增強(qiáng)子提高基因的轉(zhuǎn)錄速度,就像汽車?yán)锏募铀倨鳎瑔?dòng)子啟動(dòng)基因的轉(zhuǎn)錄,就像汽車點(diǎn)火一樣。
計(jì)算醫(yī)學(xué)與生物信息學(xué)和人類遺傳學(xué)助理教授斯蒂芬帕克博士解釋說:“有許多論文描述了不同類型的基因調(diào)控元件,但目前還不清楚它們之間是如何關(guān)聯(lián)的。
帕克說:“我們的論文是第一份真正比較它們的論文。"其中一個(gè)問題是,它們?cè)诓煌募?xì)胞類型中是不同的,表現(xiàn)也不同."
然而,UM團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn),更多細(xì)胞類型特異性增強(qiáng)子的遺傳變異對(duì)其目標(biāo)基因的影響相對(duì)較小。對(duì)于那些正在比對(duì)成千上萬人的基因組,尋找與疾病特征相關(guān)的基因變異的科學(xué)家來說,這可能會(huì)給人們帶來麻煩。
UM的作者認(rèn)為,這些基因?qū)?xì)胞功能非常重要,因此它們的轉(zhuǎn)錄在正常條件下受到嚴(yán)格調(diào)控。
帕克說:“這意味著我們需要非常大的樣本量才能看到效果。
另一個(gè)意想不到的發(fā)現(xiàn)可能最終解釋了調(diào)節(jié)因子的遺傳變異如何使疾病更有可能發(fā)生。
瓦爾什尼、帕克和他們的同事認(rèn)為,細(xì)胞特異性增強(qiáng)子和啟動(dòng)子——也就是說它們?cè)谀承╊愋偷募?xì)胞中發(fā)揮更大的作用——可以使轉(zhuǎn)錄在某些環(huán)境條件下更容易發(fā)生。
他們似乎通過使細(xì)胞染色質(zhì)更容易獲得來實(shí)現(xiàn)這個(gè)目標(biāo),染色質(zhì)是一種被細(xì)胞核中的脫氧核糖核酸包裹的致密蛋白質(zhì)分子。
瓦爾什尼說,作為這項(xiàng)研究的下一步,“我們認(rèn)為我們應(yīng)該考慮細(xì)胞在特定條件下的基因表達(dá)”?!袄?,如果你試圖研究二型糖尿病,你可以觀察高血糖的細(xì)胞,然后觀察基因表達(dá)以及基因變異如何影響基因表達(dá)。
“嗯,也許你可以更好地解釋這種基因變異是如何讓你容易感染疾病的?!?
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