腸道中的微生物混合物可以塑造一個人的免疫反應(yīng)

阿拉巴馬州伯明翰——腸道中的微生物混合物可以塑造一個人的免疫反應(yīng)。例如，在黑色素瘤的免疫治療中，腸道微生物群的組成與抗 PD-1 治療在動物模型和癌癥患者中的療效相關(guān)。

今年發(fā)表在《科學(xué)》雜志上的一項臨床試驗將成功接受抗 PD-1 黑色素瘤治療的患者的糞便移植到對抗 PD-1 治療耐藥的黑色素瘤患者的結(jié)腸中;然后接受者接受抗PD-1治療。研究人員在接受者體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一種快速而持久的微生物群擾動，15 名患者中有 6 名受益于復(fù)合療法。研究人員得出結(jié)論，糞便微生物移植能夠克服對抗PD-1療法的抵抗。

在研究人員阿拉巴馬大學(xué)伯明翰大學(xué)醫(yī)學(xué)院馬尼克斯E. Heersink學(xué)?，F(xiàn)在已經(jīng)使用了糞便宏基因組測序數(shù)據(jù)集從該研究-以及來自其他兩項研究的DNA測序數(shù)據(jù)集-看到具體的供體菌株是否建立了自己在受體患者中以及這些供體菌株是否與成功的治療結(jié)果相關(guān)。

研究人員 Hyunmin Koo 博士和 Casey Morrow 博士能夠使用 UAB 開發(fā)的微生物組“指紋”方法識別細(xì)菌物種的特定單一菌株。該方法使用強(qiáng)大的基因組工具和超級計算機(jī)來分析來自糞便樣本宏基因組測序的大量遺傳數(shù)據(jù)。

這種新的生物信息學(xué)技術(shù)此前已經(jīng)表明，除其他研究外，在肥胖手術(shù)和抑制性抗生素后出現(xiàn)了新的微生物菌株，以及在糞便微生物移植治療復(fù)發(fā)性艱難梭菌后，供體微生物菌株穩(wěn)定存在長達(dá)兩年之久。感染。

現(xiàn)在，在BMC Microbiology 上發(fā)表的一項研究中，Koo 和 Morrow 報告說，就糞便微生物移植后受體患者的糞便占優(yōu)勢的供體微生物而言，黑色素瘤患者的個體差異與對抗 PD-1 的反應(yīng)無關(guān)治療。

詳細(xì)地，他們分析了 Baruch 等人發(fā)表的宏基因組測序數(shù)據(jù)集。在 2021 年的《科學(xué)》雜志上，他發(fā)現(xiàn)糞便微生物群移植后受者患者糞便中共生供體微生物的存在與患者對免疫療法的反應(yīng)無關(guān)。

他們還分析了 Davar 等人發(fā)表的宏基因組測序。2021 年獲得科學(xué)博士學(xué)位。“來自 Davar 等人。數(shù)據(jù)集中，我們發(fā)現(xiàn)四名對免疫療法有反應(yīng)的患者在糞便微生物移植后有供體相關(guān)菌株，而對免疫療法沒有反應(yīng)的兩名患者在糞便微生物移植后也有供體菌株，”莫羅說。“重要的是，我們在一名對免疫療法有反應(yīng)的糞便微生物移植后接受者的糞便中沒有發(fā)現(xiàn)供體微生物。”

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