新研究表征腸道病毒組

華盛頓特區(qū) - 2021 年 10 月 19 日- 一項(xiàng)新研究為全球不斷增加的人類(lèi)腸道病毒組添加了許多以前未表征的病毒基因組和基因。該研究發(fā)表在美國(guó)微生物學(xué)會(huì)的開(kāi)放獲取期刊mSystems 上，將證明有助于研究腸道病毒組在人類(lèi)健康和疾病中的作用。

“人類(lèi)腸道病毒組仍未得到充分探索，許多新病毒有待發(fā)現(xiàn)，其中一些可能對(duì)影響人類(lèi)健康和疾病的過(guò)程產(chǎn)生重要影響，”該研究的首席研究員、該研究的教授 Jelle Matthijnssens 博士說(shuō)。微生物學(xué)、免疫學(xué)和移植系，Rega 研究所，臨床和流行病學(xué)病毒學(xué)部，病毒宏基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室，KU Leuven，Leuven，比利時(shí)。

人類(lèi)腸道包含一個(gè)復(fù)雜的微生物生態(tài)系統(tǒng)，其中細(xì)菌已被廣泛研究。Matthijnssens 博士說(shuō)，對(duì)腸道病毒的研究滯后。MicrobLiver 項(xiàng)目的目標(biāo)是了解宿主與人類(lèi)腸道微生物組之間的相互作用以及腸道-肝臟軸在酒精性和非酒精性脂肪肝疾病早期的作用。“在 MicrobLiver 項(xiàng)目的框架內(nèi)，我們的目標(biāo)是生成病毒基因組目錄，該目錄可用于后續(xù)對(duì)酒精性和非酒精性脂肪性肝病早期人群的研究，”Matthijnssens 博士說(shuō)。

在這項(xiàng)新研究中，研究人員使用來(lái)自 204 名丹麥?zhǔn)茉囌叩?254 份糞便樣本來(lái)生成丹麥腸道病毒目錄 (DEVoC)。兒科隊(duì)列包括 50 名體重指數(shù) (BMI) 高于第 90個(gè)百分位數(shù)的兒童和青少年(6-18 歲)，以及 50 名年齡和性別匹配的健康對(duì)照。成人隊(duì)列(34-76 歲)包括 52 名酒精相關(guān)肝病患者和 52 名性別、BMI 和年齡匹配的健康對(duì)照。

研究人員使用新型病毒富集技術(shù) (NetoVIR) 協(xié)議從糞便樣本中純化所有病毒顆粒，并使用深度測(cè)序技術(shù)對(duì)其基因組進(jìn)行測(cè)序。(NetoVir 使研究人員能夠?yàn)橄乱淮鷾y(cè)序腸道病毒組學(xué)研究獲得快速、可重復(fù)、高通量的樣品制備方案。)

此外，他們使用先進(jìn)的生物信息學(xué)工具識(shí)別了近 13,000 個(gè)(部分)病毒基因組，其中許多是新的，并且不存在于公共數(shù)據(jù)庫(kù)中。

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